Protein–RNA interactions for Protein: G5E8Z2

Taf4b, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4bG5E8Z2 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Taf4bG5E8Z2 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Taf4bG5E8Z2 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Taf4bG5E8Z2 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Taf4bG5E8Z2 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Taf4bG5E8Z2 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Taf4bG5E8Z2 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Taf4bG5E8Z2 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Taf4bG5E8Z2 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Taf4bG5E8Z2 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Taf4bG5E8Z2 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Taf4bG5E8Z2 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Taf4bG5E8Z2 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Taf4bG5E8Z2 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Taf4bG5E8Z2 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Taf4bG5E8Z2 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Taf4bG5E8Z2 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Taf4bG5E8Z2 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Taf4bG5E8Z2 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Taf4bG5E8Z2 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Taf4bG5E8Z2 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Taf4bG5E8Z2 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Taf4bG5E8Z2 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Taf4bG5E8Z2 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Taf4bG5E8Z2 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Taf4bG5E8Z2 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Taf4bG5E8Z2 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Taf4bG5E8Z2 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Taf4bG5E8Z2 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Taf4bG5E8Z2 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Taf4bG5E8Z2 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Taf4bG5E8Z2 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Taf4bG5E8Z2 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Taf4bG5E8Z2 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Taf4bG5E8Z2 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Taf4bG5E8Z2 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Taf4bG5E8Z2 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Taf4bG5E8Z2 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Taf4bG5E8Z2 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Taf4bG5E8Z2 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Taf4bG5E8Z2 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Taf4bG5E8Z2 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Taf4bG5E8Z2 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Taf4bG5E8Z2 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Taf4bG5E8Z2 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Taf4bG5E8Z2 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Taf4bG5E8Z2 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Taf4bG5E8Z2 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Taf4bG5E8Z2 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Taf4bG5E8Z2 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Taf4bG5E8Z2 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Taf4bG5E8Z2 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Taf4bG5E8Z2 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Taf4bG5E8Z2 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Taf4bG5E8Z2 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Taf4bG5E8Z2 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Taf4bG5E8Z2 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Taf4bG5E8Z2 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Taf4bG5E8Z2 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Taf4bG5E8Z2 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Taf4bG5E8Z2 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Taf4bG5E8Z2 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Taf4bG5E8Z2 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Taf4bG5E8Z2 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Taf4bG5E8Z2 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Taf4bG5E8Z2 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Taf4bG5E8Z2 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Taf4bG5E8Z2 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Taf4bG5E8Z2 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Taf4bG5E8Z2 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Taf4bG5E8Z2 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Taf4bG5E8Z2 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Taf4bG5E8Z2 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Taf4bG5E8Z2 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Taf4bG5E8Z2 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Taf4bG5E8Z2 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Taf4bG5E8Z2 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Taf4bG5E8Z2 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Taf4bG5E8Z2 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Taf4bG5E8Z2 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Taf4bG5E8Z2 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Taf4bG5E8Z2 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Taf4bG5E8Z2 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Taf4bG5E8Z2 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Taf4bG5E8Z2 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Taf4bG5E8Z2 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Taf4bG5E8Z2 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Taf4bG5E8Z2 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Taf4bG5E8Z2 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Taf4bG5E8Z2 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Taf4bG5E8Z2 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Taf4bG5E8Z2 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Taf4bG5E8Z2 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Taf4bG5E8Z2 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Taf4bG5E8Z2 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Taf4bG5E8Z2 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Taf4bG5E8Z2 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Taf4bG5E8Z2 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Taf4bG5E8Z2 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Taf4bG5E8Z2 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms