Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN9

Gm28038, Predicted gene, 28038 (Fragment), mousemouse

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28038F7BCN9 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
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Gm28038F7BCN9 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
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Gm28038F7BCN9 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 CT572999.1-201ENSMUST00000220315 1260 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Gm28038F7BCN9 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Gm28038F7BCN9 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Gm28038F7BCN9 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Gm28038F7BCN9 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Gm28038F7BCN9 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Gm28038F7BCN9 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Gm28038F7BCN9 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Gm28038F7BCN9 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Gm28038F7BCN9 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
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