Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm28048F7BCN0 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm28048F7BCN0 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm28048F7BCN0 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm28048F7BCN0 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm28048F7BCN0 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm28048F7BCN0 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm28048F7BCN0 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm28048F7BCN0 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm28048F7BCN0 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm28048F7BCN0 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm28048F7BCN0 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm28048F7BCN0 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
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Gm28048F7BCN0 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm28048F7BCN0 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm28048F7BCN0 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm28048F7BCN0 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm28048F7BCN0 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm28048F7BCN0 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm28048F7BCN0 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm28048F7BCN0 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm28048F7BCN0 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm28048F7BCN0 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm28048F7BCN0 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
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Gm28048F7BCN0 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm28048F7BCN0 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
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Gm28048F7BCN0 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm28048F7BCN0 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
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Gm28048F7BCN0 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm28048F7BCN0 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm28048F7BCN0 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
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Gm28048F7BCN0 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm28048F7BCN0 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm28048F7BCN0 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
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Gm28048F7BCN0 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm28048F7BCN0 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm28048F7BCN0 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm28048F7BCN0 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm28048F7BCN0 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm28048F7BCN0 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm28048F7BCN0 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm28048F7BCN0 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm28048F7BCN0 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm28048F7BCN0 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm28048F7BCN0 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm28048F7BCN0 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Gm28048F7BCN0 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm28048F7BCN0 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Gm28048F7BCN0 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm28048F7BCN0 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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