Protein–RNA interactions for Protein: F6YKY3

Gm8005, Predicted gene 8005 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8005F6YKY3 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Gm8005F6YKY3 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Gm8005F6YKY3 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Gm8005F6YKY3 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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