Protein–RNA interactions for Protein: F6XQQ1

Gm10378, Predicted gene 10378 (Fragment), mousemouse

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Length 160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10378F6XQQ1 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm10378F6XQQ1 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm10378F6XQQ1 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm10378F6XQQ1 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm10378F6XQQ1 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm10378F6XQQ1 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm10378F6XQQ1 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm10378F6XQQ1 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm10378F6XQQ1 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm10378F6XQQ1 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm10378F6XQQ1 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm10378F6XQQ1 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm10378F6XQQ1 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm10378F6XQQ1 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm10378F6XQQ1 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gm10378F6XQQ1 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gm10378F6XQQ1 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gm10378F6XQQ1 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm10378F6XQQ1 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm10378F6XQQ1 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm10378F6XQQ1 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm10378F6XQQ1 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm10378F6XQQ1 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm10378F6XQQ1 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm10378F6XQQ1 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm10378F6XQQ1 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gm10378F6XQQ1 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm10378F6XQQ1 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm10378F6XQQ1 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm10378F6XQQ1 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm10378F6XQQ1 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gm10378F6XQQ1 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm10378F6XQQ1 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm10378F6XQQ1 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm10378F6XQQ1 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm10378F6XQQ1 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm10378F6XQQ1 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
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Gm10378F6XQQ1 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm10378F6XQQ1 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm10378F6XQQ1 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm10378F6XQQ1 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm10378F6XQQ1 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm10378F6XQQ1 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm10378F6XQQ1 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Gm10378F6XQQ1 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Gm10378F6XQQ1 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
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Gm10378F6XQQ1 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Gm10378F6XQQ1 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm10378F6XQQ1 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm10378F6XQQ1 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm10378F6XQQ1 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm10378F6XQQ1 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gm10378F6XQQ1 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm10378F6XQQ1 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm10378F6XQQ1 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm10378F6XQQ1 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm10378F6XQQ1 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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Gm10378F6XQQ1 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm10378F6XQQ1 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gm10378F6XQQ1 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm10378F6XQQ1 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm10378F6XQQ1 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gm10378F6XQQ1 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm10378F6XQQ1 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm10378F6XQQ1 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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