Protein–RNA interactions for Protein: F6U3N7

Gm21977, Predicted gene 21977 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21977F6U3N7 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm21977F6U3N7 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm21977F6U3N7 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm21977F6U3N7 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm21977F6U3N7 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm21977F6U3N7 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm21977F6U3N7 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm21977F6U3N7 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm21977F6U3N7 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm21977F6U3N7 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm21977F6U3N7 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm21977F6U3N7 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm21977F6U3N7 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm21977F6U3N7 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Gm21977F6U3N7 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm21977F6U3N7 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm21977F6U3N7 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm21977F6U3N7 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm21977F6U3N7 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm21977F6U3N7 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm21977F6U3N7 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm21977F6U3N7 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm21977F6U3N7 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm21977F6U3N7 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm21977F6U3N7 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm21977F6U3N7 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm21977F6U3N7 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm21977F6U3N7 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm21977F6U3N7 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm21977F6U3N7 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm21977F6U3N7 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm21977F6U3N7 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm21977F6U3N7 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm21977F6U3N7 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm21977F6U3N7 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm21977F6U3N7 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm21977F6U3N7 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm21977F6U3N7 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm21977F6U3N7 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm21977F6U3N7 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm21977F6U3N7 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm21977F6U3N7 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm21977F6U3N7 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm21977F6U3N7 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm21977F6U3N7 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm21977F6U3N7 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm21977F6U3N7 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm21977F6U3N7 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm21977F6U3N7 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm21977F6U3N7 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm21977F6U3N7 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm21977F6U3N7 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm21977F6U3N7 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm21977F6U3N7 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm21977F6U3N7 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm21977F6U3N7 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm21977F6U3N7 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm21977F6U3N7 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm21977F6U3N7 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm21977F6U3N7 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm21977F6U3N7 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm21977F6U3N7 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm21977F6U3N7 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm21977F6U3N7 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm21977F6U3N7 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm21977F6U3N7 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm21977F6U3N7 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm21977F6U3N7 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm21977F6U3N7 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm21977F6U3N7 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm21977F6U3N7 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm21977F6U3N7 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm21977F6U3N7 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm21977F6U3N7 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm21977F6U3N7 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm21977F6U3N7 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm21977F6U3N7 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm21977F6U3N7 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm21977F6U3N7 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm21977F6U3N7 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm21977F6U3N7 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm21977F6U3N7 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm21977F6U3N7 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm21977F6U3N7 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm21977F6U3N7 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm21977F6U3N7 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm21977F6U3N7 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm21977F6U3N7 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm21977F6U3N7 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm21977F6U3N7 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm21977F6U3N7 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm21977F6U3N7 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm21977F6U3N7 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm21977F6U3N7 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm21977F6U3N7 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm21977F6U3N7 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm21977F6U3N7 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm21977F6U3N7 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm21977F6U3N7 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm21977F6U3N7 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms