Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Q2

R3hdm1, R3H domain-containing 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3hdm1E9Q9Q2 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
R3hdm1E9Q9Q2 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
R3hdm1E9Q9Q2 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
R3hdm1E9Q9Q2 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
R3hdm1E9Q9Q2 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
R3hdm1E9Q9Q2 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
R3hdm1E9Q9Q2 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
R3hdm1E9Q9Q2 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
R3hdm1E9Q9Q2 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
R3hdm1E9Q9Q2 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms