Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M1

Pdzd2, PDZ domain-containing 2, mousemouse

Predictions only

Length 2,796 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd2E9Q1M1 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pdzd2E9Q1M1 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pdzd2E9Q1M1 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pdzd2E9Q1M1 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pdzd2E9Q1M1 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pdzd2E9Q1M1 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pdzd2E9Q1M1 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pdzd2E9Q1M1 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Pdzd2E9Q1M1 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pdzd2E9Q1M1 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pdzd2E9Q1M1 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pdzd2E9Q1M1 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pdzd2E9Q1M1 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pdzd2E9Q1M1 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pdzd2E9Q1M1 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pdzd2E9Q1M1 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pdzd2E9Q1M1 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pdzd2E9Q1M1 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pdzd2E9Q1M1 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pdzd2E9Q1M1 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pdzd2E9Q1M1 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pdzd2E9Q1M1 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pdzd2E9Q1M1 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Pdzd2E9Q1M1 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Pdzd2E9Q1M1 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Pdzd2E9Q1M1 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pdzd2E9Q1M1 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pdzd2E9Q1M1 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pdzd2E9Q1M1 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Pdzd2E9Q1M1 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Pdzd2E9Q1M1 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Pdzd2E9Q1M1 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Pdzd2E9Q1M1 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Pdzd2E9Q1M1 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Pdzd2E9Q1M1 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Pdzd2E9Q1M1 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Pdzd2E9Q1M1 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pdzd2E9Q1M1 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Pdzd2E9Q1M1 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pdzd2E9Q1M1 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pdzd2E9Q1M1 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pdzd2E9Q1M1 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Pdzd2E9Q1M1 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Pdzd2E9Q1M1 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pdzd2E9Q1M1 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pdzd2E9Q1M1 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pdzd2E9Q1M1 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pdzd2E9Q1M1 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pdzd2E9Q1M1 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pdzd2E9Q1M1 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pdzd2E9Q1M1 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pdzd2E9Q1M1 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pdzd2E9Q1M1 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pdzd2E9Q1M1 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pdzd2E9Q1M1 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pdzd2E9Q1M1 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pdzd2E9Q1M1 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pdzd2E9Q1M1 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pdzd2E9Q1M1 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pdzd2E9Q1M1 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pdzd2E9Q1M1 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pdzd2E9Q1M1 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Pdzd2E9Q1M1 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Pdzd2E9Q1M1 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
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Pdzd2E9Q1M1 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pdzd2E9Q1M1 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pdzd2E9Q1M1 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pdzd2E9Q1M1 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pdzd2E9Q1M1 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pdzd2E9Q1M1 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Pdzd2E9Q1M1 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pdzd2E9Q1M1 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pdzd2E9Q1M1 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pdzd2E9Q1M1 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pdzd2E9Q1M1 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pdzd2E9Q1M1 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pdzd2E9Q1M1 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pdzd2E9Q1M1 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pdzd2E9Q1M1 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pdzd2E9Q1M1 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pdzd2E9Q1M1 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pdzd2E9Q1M1 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pdzd2E9Q1M1 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pdzd2E9Q1M1 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Pdzd2E9Q1M1 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Pdzd2E9Q1M1 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Pdzd2E9Q1M1 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Pdzd2E9Q1M1 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pdzd2E9Q1M1 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pdzd2E9Q1M1 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pdzd2E9Q1M1 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Pdzd2E9Q1M1 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pdzd2E9Q1M1 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pdzd2E9Q1M1 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pdzd2E9Q1M1 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pdzd2E9Q1M1 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pdzd2E9Q1M1 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pdzd2E9Q1M1 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
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