Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1F5

Myo5c, Myosin VC, mousemouse

Predictions only

Length 1,742 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo5cE9Q1F5 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Myo5cE9Q1F5 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Myo5cE9Q1F5 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Myo5cE9Q1F5 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Myo5cE9Q1F5 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Myo5cE9Q1F5 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Myo5cE9Q1F5 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Myo5cE9Q1F5 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Myo5cE9Q1F5 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Myo5cE9Q1F5 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Myo5cE9Q1F5 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Myo5cE9Q1F5 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Myo5cE9Q1F5 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Myo5cE9Q1F5 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Myo5cE9Q1F5 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Myo5cE9Q1F5 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Myo5cE9Q1F5 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Myo5cE9Q1F5 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Myo5cE9Q1F5 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Myo5cE9Q1F5 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Myo5cE9Q1F5 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Myo5cE9Q1F5 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Myo5cE9Q1F5 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Myo5cE9Q1F5 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Myo5cE9Q1F5 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Myo5cE9Q1F5 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Myo5cE9Q1F5 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Myo5cE9Q1F5 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Myo5cE9Q1F5 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Myo5cE9Q1F5 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Myo5cE9Q1F5 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Myo5cE9Q1F5 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Myo5cE9Q1F5 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Myo5cE9Q1F5 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Myo5cE9Q1F5 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Myo5cE9Q1F5 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Myo5cE9Q1F5 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Myo5cE9Q1F5 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Myo5cE9Q1F5 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Myo5cE9Q1F5 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Myo5cE9Q1F5 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Myo5cE9Q1F5 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Myo5cE9Q1F5 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Myo5cE9Q1F5 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Myo5cE9Q1F5 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Myo5cE9Q1F5 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Myo5cE9Q1F5 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Myo5cE9Q1F5 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Myo5cE9Q1F5 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Myo5cE9Q1F5 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Myo5cE9Q1F5 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Myo5cE9Q1F5 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Myo5cE9Q1F5 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Myo5cE9Q1F5 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Myo5cE9Q1F5 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Myo5cE9Q1F5 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Myo5cE9Q1F5 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Myo5cE9Q1F5 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Myo5cE9Q1F5 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Myo5cE9Q1F5 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Myo5cE9Q1F5 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Myo5cE9Q1F5 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Myo5cE9Q1F5 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Myo5cE9Q1F5 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Myo5cE9Q1F5 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Myo5cE9Q1F5 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Myo5cE9Q1F5 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Myo5cE9Q1F5 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Myo5cE9Q1F5 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Myo5cE9Q1F5 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Myo5cE9Q1F5 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Myo5cE9Q1F5 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Myo5cE9Q1F5 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Myo5cE9Q1F5 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Myo5cE9Q1F5 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Myo5cE9Q1F5 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Myo5cE9Q1F5 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Myo5cE9Q1F5 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Myo5cE9Q1F5 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Myo5cE9Q1F5 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Myo5cE9Q1F5 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Myo5cE9Q1F5 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Myo5cE9Q1F5 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Myo5cE9Q1F5 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Myo5cE9Q1F5 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Myo5cE9Q1F5 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Myo5cE9Q1F5 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Myo5cE9Q1F5 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Myo5cE9Q1F5 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Myo5cE9Q1F5 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Myo5cE9Q1F5 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Myo5cE9Q1F5 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Myo5cE9Q1F5 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Myo5cE9Q1F5 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Myo5cE9Q1F5 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Myo5cE9Q1F5 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Myo5cE9Q1F5 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Myo5cE9Q1F5 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Myo5cE9Q1F5 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Myo5cE9Q1F5 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.9 ms