Protein–RNA interactions for Protein: E9PYQ0

Rsph10b, Radial spoke head 10 homolog B (Chlamydomonas), mousemouse

Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph10bE9PYQ0 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rsph10bE9PYQ0 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rsph10bE9PYQ0 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rsph10bE9PYQ0 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rsph10bE9PYQ0 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rsph10bE9PYQ0 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rsph10bE9PYQ0 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rsph10bE9PYQ0 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rsph10bE9PYQ0 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rsph10bE9PYQ0 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rsph10bE9PYQ0 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rsph10bE9PYQ0 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rsph10bE9PYQ0 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rsph10bE9PYQ0 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rsph10bE9PYQ0 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rsph10bE9PYQ0 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rsph10bE9PYQ0 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rsph10bE9PYQ0 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rsph10bE9PYQ0 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rsph10bE9PYQ0 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rsph10bE9PYQ0 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rsph10bE9PYQ0 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rsph10bE9PYQ0 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rsph10bE9PYQ0 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rsph10bE9PYQ0 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rsph10bE9PYQ0 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rsph10bE9PYQ0 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rsph10bE9PYQ0 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rsph10bE9PYQ0 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rsph10bE9PYQ0 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rsph10bE9PYQ0 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rsph10bE9PYQ0 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rsph10bE9PYQ0 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rsph10bE9PYQ0 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rsph10bE9PYQ0 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rsph10bE9PYQ0 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rsph10bE9PYQ0 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rsph10bE9PYQ0 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rsph10bE9PYQ0 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rsph10bE9PYQ0 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rsph10bE9PYQ0 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rsph10bE9PYQ0 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rsph10bE9PYQ0 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rsph10bE9PYQ0 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rsph10bE9PYQ0 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rsph10bE9PYQ0 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rsph10bE9PYQ0 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rsph10bE9PYQ0 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rsph10bE9PYQ0 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rsph10bE9PYQ0 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rsph10bE9PYQ0 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rsph10bE9PYQ0 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rsph10bE9PYQ0 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rsph10bE9PYQ0 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rsph10bE9PYQ0 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rsph10bE9PYQ0 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rsph10bE9PYQ0 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rsph10bE9PYQ0 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rsph10bE9PYQ0 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rsph10bE9PYQ0 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rsph10bE9PYQ0 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rsph10bE9PYQ0 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rsph10bE9PYQ0 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rsph10bE9PYQ0 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rsph10bE9PYQ0 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rsph10bE9PYQ0 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rsph10bE9PYQ0 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rsph10bE9PYQ0 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rsph10bE9PYQ0 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rsph10bE9PYQ0 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rsph10bE9PYQ0 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rsph10bE9PYQ0 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rsph10bE9PYQ0 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rsph10bE9PYQ0 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rsph10bE9PYQ0 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rsph10bE9PYQ0 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rsph10bE9PYQ0 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rsph10bE9PYQ0 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rsph10bE9PYQ0 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rsph10bE9PYQ0 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rsph10bE9PYQ0 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rsph10bE9PYQ0 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rsph10bE9PYQ0 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rsph10bE9PYQ0 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rsph10bE9PYQ0 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rsph10bE9PYQ0 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rsph10bE9PYQ0 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rsph10bE9PYQ0 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rsph10bE9PYQ0 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rsph10bE9PYQ0 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rsph10bE9PYQ0 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rsph10bE9PYQ0 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rsph10bE9PYQ0 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rsph10bE9PYQ0 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rsph10bE9PYQ0 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rsph10bE9PYQ0 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rsph10bE9PYQ0 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rsph10bE9PYQ0 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rsph10bE9PYQ0 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rsph10bE9PYQ0 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms