Protein–RNA interactions for Protein: E9PXC0

Srp54b, Signal recognition particle 54 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp54bE9PXC0 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Srp54bE9PXC0 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Srp54bE9PXC0 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Srp54bE9PXC0 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Srp54bE9PXC0 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Srp54bE9PXC0 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Srp54bE9PXC0 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Srp54bE9PXC0 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Srp54bE9PXC0 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Srp54bE9PXC0 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Srp54bE9PXC0 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Srp54bE9PXC0 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Srp54bE9PXC0 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Srp54bE9PXC0 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Srp54bE9PXC0 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Srp54bE9PXC0 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Srp54bE9PXC0 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Srp54bE9PXC0 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Srp54bE9PXC0 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Srp54bE9PXC0 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Srp54bE9PXC0 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Srp54bE9PXC0 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Srp54bE9PXC0 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Srp54bE9PXC0 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Srp54bE9PXC0 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Srp54bE9PXC0 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Srp54bE9PXC0 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Srp54bE9PXC0 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Srp54bE9PXC0 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Srp54bE9PXC0 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Srp54bE9PXC0 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Srp54bE9PXC0 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Srp54bE9PXC0 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Srp54bE9PXC0 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Srp54bE9PXC0 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Srp54bE9PXC0 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Srp54bE9PXC0 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Srp54bE9PXC0 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Srp54bE9PXC0 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Srp54bE9PXC0 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Srp54bE9PXC0 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Srp54bE9PXC0 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Srp54bE9PXC0 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Srp54bE9PXC0 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Srp54bE9PXC0 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Srp54bE9PXC0 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Srp54bE9PXC0 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Srp54bE9PXC0 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Srp54bE9PXC0 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Srp54bE9PXC0 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Srp54bE9PXC0 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Srp54bE9PXC0 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Srp54bE9PXC0 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Srp54bE9PXC0 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Srp54bE9PXC0 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Srp54bE9PXC0 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Srp54bE9PXC0 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Srp54bE9PXC0 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Srp54bE9PXC0 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Srp54bE9PXC0 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Srp54bE9PXC0 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Srp54bE9PXC0 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Srp54bE9PXC0 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Srp54bE9PXC0 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Srp54bE9PXC0 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Srp54bE9PXC0 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Srp54bE9PXC0 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Srp54bE9PXC0 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Srp54bE9PXC0 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Srp54bE9PXC0 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Srp54bE9PXC0 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Srp54bE9PXC0 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Srp54bE9PXC0 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Srp54bE9PXC0 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Srp54bE9PXC0 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Srp54bE9PXC0 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Srp54bE9PXC0 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Srp54bE9PXC0 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Srp54bE9PXC0 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Srp54bE9PXC0 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Srp54bE9PXC0 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Srp54bE9PXC0 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Srp54bE9PXC0 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Srp54bE9PXC0 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Srp54bE9PXC0 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Srp54bE9PXC0 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Srp54bE9PXC0 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Srp54bE9PXC0 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Srp54bE9PXC0 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Srp54bE9PXC0 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Srp54bE9PXC0 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Srp54bE9PXC0 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Srp54bE9PXC0 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Srp54bE9PXC0 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Srp54bE9PXC0 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Srp54bE9PXC0 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Srp54bE9PXC0 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Srp54bE9PXC0 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Srp54bE9PXC0 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Srp54bE9PXC0 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms