Protein–RNA interactions for Protein: E9PUP1

Syde2, Synapse defective 1, Rho GTPase, homolog 2 (C. elegans), mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde2E9PUP1 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Syde2E9PUP1 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Syde2E9PUP1 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Syde2E9PUP1 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Syde2E9PUP1 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Syde2E9PUP1 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Syde2E9PUP1 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Syde2E9PUP1 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Syde2E9PUP1 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Syde2E9PUP1 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Syde2E9PUP1 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Syde2E9PUP1 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Syde2E9PUP1 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Syde2E9PUP1 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Syde2E9PUP1 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Syde2E9PUP1 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Syde2E9PUP1 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Syde2E9PUP1 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Syde2E9PUP1 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Syde2E9PUP1 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Syde2E9PUP1 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Syde2E9PUP1 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Syde2E9PUP1 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Syde2E9PUP1 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Syde2E9PUP1 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Syde2E9PUP1 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Syde2E9PUP1 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Syde2E9PUP1 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Syde2E9PUP1 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Syde2E9PUP1 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Syde2E9PUP1 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Syde2E9PUP1 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Syde2E9PUP1 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Syde2E9PUP1 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Syde2E9PUP1 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Syde2E9PUP1 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Syde2E9PUP1 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Syde2E9PUP1 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Syde2E9PUP1 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Syde2E9PUP1 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Syde2E9PUP1 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Syde2E9PUP1 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Syde2E9PUP1 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Syde2E9PUP1 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Syde2E9PUP1 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Syde2E9PUP1 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Syde2E9PUP1 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Syde2E9PUP1 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Syde2E9PUP1 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Syde2E9PUP1 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Syde2E9PUP1 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Syde2E9PUP1 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Syde2E9PUP1 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Syde2E9PUP1 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Syde2E9PUP1 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Syde2E9PUP1 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Syde2E9PUP1 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Syde2E9PUP1 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Syde2E9PUP1 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Syde2E9PUP1 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Syde2E9PUP1 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Syde2E9PUP1 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Syde2E9PUP1 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Syde2E9PUP1 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Syde2E9PUP1 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Syde2E9PUP1 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Syde2E9PUP1 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Syde2E9PUP1 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Syde2E9PUP1 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Syde2E9PUP1 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Syde2E9PUP1 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Syde2E9PUP1 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Syde2E9PUP1 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Syde2E9PUP1 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Syde2E9PUP1 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Syde2E9PUP1 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Syde2E9PUP1 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Syde2E9PUP1 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Syde2E9PUP1 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Syde2E9PUP1 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Syde2E9PUP1 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Syde2E9PUP1 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Syde2E9PUP1 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Syde2E9PUP1 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Syde2E9PUP1 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Syde2E9PUP1 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Syde2E9PUP1 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Syde2E9PUP1 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Syde2E9PUP1 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Syde2E9PUP1 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Syde2E9PUP1 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Syde2E9PUP1 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Syde2E9PUP1 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Syde2E9PUP1 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Syde2E9PUP1 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Syde2E9PUP1 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Syde2E9PUP1 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Syde2E9PUP1 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Syde2E9PUP1 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Syde2E9PUP1 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms