Protein–RNA interactions for Protein: D3Z4U6

Gm5934, Predicted gene 5934, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5934D3Z4U6 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5934D3Z4U6 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5934D3Z4U6 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5934D3Z4U6 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5934D3Z4U6 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5934D3Z4U6 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5934D3Z4U6 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5934D3Z4U6 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5934D3Z4U6 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5934D3Z4U6 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5934D3Z4U6 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5934D3Z4U6 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5934D3Z4U6 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5934D3Z4U6 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5934D3Z4U6 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5934D3Z4U6 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5934D3Z4U6 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5934D3Z4U6 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5934D3Z4U6 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5934D3Z4U6 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5934D3Z4U6 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5934D3Z4U6 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5934D3Z4U6 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5934D3Z4U6 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5934D3Z4U6 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5934D3Z4U6 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5934D3Z4U6 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5934D3Z4U6 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5934D3Z4U6 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5934D3Z4U6 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5934D3Z4U6 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5934D3Z4U6 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5934D3Z4U6 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5934D3Z4U6 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5934D3Z4U6 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5934D3Z4U6 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5934D3Z4U6 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5934D3Z4U6 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5934D3Z4U6 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5934D3Z4U6 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5934D3Z4U6 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5934D3Z4U6 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5934D3Z4U6 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5934D3Z4U6 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5934D3Z4U6 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5934D3Z4U6 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5934D3Z4U6 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5934D3Z4U6 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5934D3Z4U6 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5934D3Z4U6 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5934D3Z4U6 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5934D3Z4U6 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5934D3Z4U6 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5934D3Z4U6 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5934D3Z4U6 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5934D3Z4U6 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5934D3Z4U6 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5934D3Z4U6 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5934D3Z4U6 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5934D3Z4U6 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5934D3Z4U6 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5934D3Z4U6 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5934D3Z4U6 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5934D3Z4U6 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5934D3Z4U6 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5934D3Z4U6 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5934D3Z4U6 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5934D3Z4U6 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5934D3Z4U6 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5934D3Z4U6 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5934D3Z4U6 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5934D3Z4U6 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5934D3Z4U6 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5934D3Z4U6 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5934D3Z4U6 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5934D3Z4U6 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5934D3Z4U6 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5934D3Z4U6 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5934D3Z4U6 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5934D3Z4U6 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5934D3Z4U6 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5934D3Z4U6 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5934D3Z4U6 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5934D3Z4U6 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5934D3Z4U6 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5934D3Z4U6 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5934D3Z4U6 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5934D3Z4U6 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5934D3Z4U6 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5934D3Z4U6 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5934D3Z4U6 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5934D3Z4U6 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5934D3Z4U6 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5934D3Z4U6 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5934D3Z4U6 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5934D3Z4U6 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5934D3Z4U6 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5934D3Z4U6 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5934D3Z4U6 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5934D3Z4U6 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms