Protein–RNA interactions for Protein: D3YXS5

Kif28p, Kinesin-like protein KIF28P, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif28pD3YXS5 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Kif28pD3YXS5 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Kif28pD3YXS5 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Kif28pD3YXS5 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Kif28pD3YXS5 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Kif28pD3YXS5 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Kif28pD3YXS5 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Kif28pD3YXS5 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Kif28pD3YXS5 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Kif28pD3YXS5 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Kif28pD3YXS5 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Kif28pD3YXS5 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Kif28pD3YXS5 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Kif28pD3YXS5 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Kif28pD3YXS5 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Kif28pD3YXS5 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Kif28pD3YXS5 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Kif28pD3YXS5 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Kif28pD3YXS5 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Kif28pD3YXS5 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Kif28pD3YXS5 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Kif28pD3YXS5 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Kif28pD3YXS5 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Kif28pD3YXS5 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Kif28pD3YXS5 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Kif28pD3YXS5 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Kif28pD3YXS5 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Kif28pD3YXS5 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Kif28pD3YXS5 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Kif28pD3YXS5 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Kif28pD3YXS5 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Kif28pD3YXS5 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Kif28pD3YXS5 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Kif28pD3YXS5 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Kif28pD3YXS5 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Kif28pD3YXS5 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Kif28pD3YXS5 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Kif28pD3YXS5 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Kif28pD3YXS5 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Kif28pD3YXS5 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Kif28pD3YXS5 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Kif28pD3YXS5 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Kif28pD3YXS5 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Kif28pD3YXS5 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Kif28pD3YXS5 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Kif28pD3YXS5 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Kif28pD3YXS5 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Kif28pD3YXS5 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Kif28pD3YXS5 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Kif28pD3YXS5 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Kif28pD3YXS5 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Kif28pD3YXS5 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Kif28pD3YXS5 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Kif28pD3YXS5 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
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Kif28pD3YXS5 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
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Kif28pD3YXS5 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Kif28pD3YXS5 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Kif28pD3YXS5 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Kif28pD3YXS5 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
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Kif28pD3YXS5 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Kif28pD3YXS5 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Kif28pD3YXS5 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Kif28pD3YXS5 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Kif28pD3YXS5 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Kif28pD3YXS5 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Kif28pD3YXS5 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Kif28pD3YXS5 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Kif28pD3YXS5 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Kif28pD3YXS5 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Kif28pD3YXS5 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Kif28pD3YXS5 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Kif28pD3YXS5 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Kif28pD3YXS5 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Kif28pD3YXS5 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Kif28pD3YXS5 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Kif28pD3YXS5 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Kif28pD3YXS5 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Kif28pD3YXS5 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Kif28pD3YXS5 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Kif28pD3YXS5 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Kif28pD3YXS5 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Kif28pD3YXS5 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Kif28pD3YXS5 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Kif28pD3YXS5 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Kif28pD3YXS5 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms