Protein–RNA interactions for Protein: D3YVI9

Trim30c, Tripartite motif-containing 30C, mousemouse

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30cD3YVI9 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim30cD3YVI9 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim30cD3YVI9 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim30cD3YVI9 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim30cD3YVI9 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim30cD3YVI9 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim30cD3YVI9 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim30cD3YVI9 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim30cD3YVI9 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim30cD3YVI9 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim30cD3YVI9 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim30cD3YVI9 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim30cD3YVI9 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim30cD3YVI9 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim30cD3YVI9 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim30cD3YVI9 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim30cD3YVI9 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim30cD3YVI9 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim30cD3YVI9 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim30cD3YVI9 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim30cD3YVI9 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim30cD3YVI9 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim30cD3YVI9 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim30cD3YVI9 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim30cD3YVI9 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim30cD3YVI9 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim30cD3YVI9 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim30cD3YVI9 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim30cD3YVI9 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim30cD3YVI9 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim30cD3YVI9 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim30cD3YVI9 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim30cD3YVI9 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim30cD3YVI9 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trim30cD3YVI9 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trim30cD3YVI9 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trim30cD3YVI9 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Trim30cD3YVI9 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trim30cD3YVI9 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trim30cD3YVI9 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Trim30cD3YVI9 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim30cD3YVI9 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim30cD3YVI9 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim30cD3YVI9 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Trim30cD3YVI9 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim30cD3YVI9 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Trim30cD3YVI9 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Trim30cD3YVI9 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Trim30cD3YVI9 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Trim30cD3YVI9 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim30cD3YVI9 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim30cD3YVI9 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Trim30cD3YVI9 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim30cD3YVI9 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Trim30cD3YVI9 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim30cD3YVI9 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim30cD3YVI9 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim30cD3YVI9 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim30cD3YVI9 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Trim30cD3YVI9 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim30cD3YVI9 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim30cD3YVI9 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim30cD3YVI9 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Trim30cD3YVI9 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim30cD3YVI9 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim30cD3YVI9 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim30cD3YVI9 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim30cD3YVI9 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim30cD3YVI9 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim30cD3YVI9 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim30cD3YVI9 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim30cD3YVI9 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim30cD3YVI9 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim30cD3YVI9 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim30cD3YVI9 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim30cD3YVI9 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim30cD3YVI9 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim30cD3YVI9 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim30cD3YVI9 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Trim30cD3YVI9 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim30cD3YVI9 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim30cD3YVI9 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trim30cD3YVI9 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim30cD3YVI9 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim30cD3YVI9 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim30cD3YVI9 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trim30cD3YVI9 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trim30cD3YVI9 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim30cD3YVI9 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim30cD3YVI9 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim30cD3YVI9 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim30cD3YVI9 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim30cD3YVI9 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim30cD3YVI9 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim30cD3YVI9 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim30cD3YVI9 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim30cD3YVI9 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim30cD3YVI9 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trim30cD3YVI9 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Trim30cD3YVI9 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms