Protein–RNA interactions for Protein: B4XVP9

Phf11c, PHD finger protein 11C, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11cB4XVP9 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
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