Protein–RNA interactions for Protein: B2RX88

Cspp1, Centrosome and spindle pole associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspp1B2RX88 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cspp1B2RX88 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cspp1B2RX88 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cspp1B2RX88 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cspp1B2RX88 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cspp1B2RX88 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cspp1B2RX88 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cspp1B2RX88 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cspp1B2RX88 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cspp1B2RX88 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cspp1B2RX88 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cspp1B2RX88 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cspp1B2RX88 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cspp1B2RX88 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cspp1B2RX88 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cspp1B2RX88 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cspp1B2RX88 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cspp1B2RX88 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cspp1B2RX88 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cspp1B2RX88 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cspp1B2RX88 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cspp1B2RX88 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cspp1B2RX88 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cspp1B2RX88 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cspp1B2RX88 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cspp1B2RX88 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cspp1B2RX88 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cspp1B2RX88 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cspp1B2RX88 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cspp1B2RX88 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cspp1B2RX88 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cspp1B2RX88 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cspp1B2RX88 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cspp1B2RX88 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cspp1B2RX88 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cspp1B2RX88 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cspp1B2RX88 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cspp1B2RX88 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cspp1B2RX88 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cspp1B2RX88 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cspp1B2RX88 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cspp1B2RX88 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cspp1B2RX88 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cspp1B2RX88 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cspp1B2RX88 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cspp1B2RX88 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cspp1B2RX88 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cspp1B2RX88 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cspp1B2RX88 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cspp1B2RX88 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cspp1B2RX88 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cspp1B2RX88 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cspp1B2RX88 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cspp1B2RX88 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cspp1B2RX88 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cspp1B2RX88 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cspp1B2RX88 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cspp1B2RX88 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cspp1B2RX88 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cspp1B2RX88 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cspp1B2RX88 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cspp1B2RX88 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cspp1B2RX88 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cspp1B2RX88 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cspp1B2RX88 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cspp1B2RX88 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cspp1B2RX88 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cspp1B2RX88 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cspp1B2RX88 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cspp1B2RX88 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cspp1B2RX88 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cspp1B2RX88 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cspp1B2RX88 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cspp1B2RX88 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cspp1B2RX88 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cspp1B2RX88 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cspp1B2RX88 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cspp1B2RX88 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cspp1B2RX88 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cspp1B2RX88 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cspp1B2RX88 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cspp1B2RX88 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cspp1B2RX88 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cspp1B2RX88 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cspp1B2RX88 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cspp1B2RX88 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cspp1B2RX88 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cspp1B2RX88 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cspp1B2RX88 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cspp1B2RX88 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cspp1B2RX88 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Cspp1B2RX88 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Cspp1B2RX88 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Cspp1B2RX88 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Cspp1B2RX88 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cspp1B2RX88 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cspp1B2RX88 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cspp1B2RX88 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Cspp1B2RX88 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cspp1B2RX88 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms