Protein–RNA interactions for Protein: B2RW38

Cfap58, Cilia- and flagella-associated protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap58B2RW38 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cfap58B2RW38 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cfap58B2RW38 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cfap58B2RW38 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cfap58B2RW38 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cfap58B2RW38 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cfap58B2RW38 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cfap58B2RW38 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cfap58B2RW38 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cfap58B2RW38 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cfap58B2RW38 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cfap58B2RW38 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cfap58B2RW38 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cfap58B2RW38 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cfap58B2RW38 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cfap58B2RW38 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cfap58B2RW38 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cfap58B2RW38 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cfap58B2RW38 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cfap58B2RW38 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cfap58B2RW38 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cfap58B2RW38 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cfap58B2RW38 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cfap58B2RW38 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cfap58B2RW38 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cfap58B2RW38 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cfap58B2RW38 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cfap58B2RW38 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cfap58B2RW38 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cfap58B2RW38 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cfap58B2RW38 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cfap58B2RW38 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cfap58B2RW38 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cfap58B2RW38 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cfap58B2RW38 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cfap58B2RW38 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cfap58B2RW38 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cfap58B2RW38 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cfap58B2RW38 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Cfap58B2RW38 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cfap58B2RW38 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cfap58B2RW38 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cfap58B2RW38 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cfap58B2RW38 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cfap58B2RW38 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cfap58B2RW38 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cfap58B2RW38 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cfap58B2RW38 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Cfap58B2RW38 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cfap58B2RW38 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Cfap58B2RW38 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cfap58B2RW38 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Cfap58B2RW38 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cfap58B2RW38 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cfap58B2RW38 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cfap58B2RW38 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Cfap58B2RW38 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Cfap58B2RW38 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cfap58B2RW38 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Cfap58B2RW38 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cfap58B2RW38 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cfap58B2RW38 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cfap58B2RW38 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cfap58B2RW38 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cfap58B2RW38 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cfap58B2RW38 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cfap58B2RW38 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cfap58B2RW38 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cfap58B2RW38 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cfap58B2RW38 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cfap58B2RW38 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cfap58B2RW38 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cfap58B2RW38 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cfap58B2RW38 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cfap58B2RW38 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cfap58B2RW38 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cfap58B2RW38 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cfap58B2RW38 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Cfap58B2RW38 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cfap58B2RW38 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Cfap58B2RW38 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cfap58B2RW38 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cfap58B2RW38 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cfap58B2RW38 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cfap58B2RW38 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cfap58B2RW38 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cfap58B2RW38 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cfap58B2RW38 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cfap58B2RW38 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cfap58B2RW38 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cfap58B2RW38 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cfap58B2RW38 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cfap58B2RW38 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cfap58B2RW38 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cfap58B2RW38 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cfap58B2RW38 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cfap58B2RW38 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cfap58B2RW38 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Cfap58B2RW38 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cfap58B2RW38 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.5 ms