Protein–RNA interactions for Protein: B2RUM3

AU015836, AU015836 protein, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AU015836B2RUM3 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
AU015836B2RUM3 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AU015836B2RUM3 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AU015836B2RUM3 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AU015836B2RUM3 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AU015836B2RUM3 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AU015836B2RUM3 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AU015836B2RUM3 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AU015836B2RUM3 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AU015836B2RUM3 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AU015836B2RUM3 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AU015836B2RUM3 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AU015836B2RUM3 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AU015836B2RUM3 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AU015836B2RUM3 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AU015836B2RUM3 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AU015836B2RUM3 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AU015836B2RUM3 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AU015836B2RUM3 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AU015836B2RUM3 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AU015836B2RUM3 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
AU015836B2RUM3 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AU015836B2RUM3 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AU015836B2RUM3 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AU015836B2RUM3 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AU015836B2RUM3 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
AU015836B2RUM3 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AU015836B2RUM3 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AU015836B2RUM3 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AU015836B2RUM3 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
AU015836B2RUM3 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AU015836B2RUM3 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AU015836B2RUM3 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AU015836B2RUM3 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AU015836B2RUM3 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AU015836B2RUM3 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AU015836B2RUM3 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AU015836B2RUM3 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AU015836B2RUM3 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AU015836B2RUM3 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AU015836B2RUM3 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AU015836B2RUM3 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AU015836B2RUM3 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AU015836B2RUM3 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AU015836B2RUM3 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AU015836B2RUM3 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AU015836B2RUM3 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AU015836B2RUM3 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AU015836B2RUM3 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AU015836B2RUM3 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AU015836B2RUM3 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AU015836B2RUM3 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AU015836B2RUM3 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AU015836B2RUM3 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AU015836B2RUM3 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AU015836B2RUM3 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AU015836B2RUM3 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AU015836B2RUM3 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AU015836B2RUM3 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AU015836B2RUM3 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AU015836B2RUM3 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
AU015836B2RUM3 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AU015836B2RUM3 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AU015836B2RUM3 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AU015836B2RUM3 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AU015836B2RUM3 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AU015836B2RUM3 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AU015836B2RUM3 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AU015836B2RUM3 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AU015836B2RUM3 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AU015836B2RUM3 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AU015836B2RUM3 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AU015836B2RUM3 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AU015836B2RUM3 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AU015836B2RUM3 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
AU015836B2RUM3 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
AU015836B2RUM3 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
AU015836B2RUM3 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
AU015836B2RUM3 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
AU015836B2RUM3 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
AU015836B2RUM3 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
AU015836B2RUM3 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
AU015836B2RUM3 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
AU015836B2RUM3 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
AU015836B2RUM3 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
AU015836B2RUM3 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AU015836B2RUM3 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AU015836B2RUM3 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AU015836B2RUM3 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
AU015836B2RUM3 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AU015836B2RUM3 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AU015836B2RUM3 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AU015836B2RUM3 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AU015836B2RUM3 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AU015836B2RUM3 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AU015836B2RUM3 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AU015836B2RUM3 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AU015836B2RUM3 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AU015836B2RUM3 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AU015836B2RUM3 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms