Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PtprbB2RU80 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PtprbB2RU80 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
PtprbB2RU80 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
PtprbB2RU80 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
PtprbB2RU80 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
PtprbB2RU80 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
PtprbB2RU80 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PtprbB2RU80 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
PtprbB2RU80 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
PtprbB2RU80 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PtprbB2RU80 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
PtprbB2RU80 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PtprbB2RU80 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PtprbB2RU80 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PtprbB2RU80 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PtprbB2RU80 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
PtprbB2RU80 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PtprbB2RU80 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PtprbB2RU80 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PtprbB2RU80 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PtprbB2RU80 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PtprbB2RU80 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PtprbB2RU80 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PtprbB2RU80 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
PtprbB2RU80 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
PtprbB2RU80 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
PtprbB2RU80 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PtprbB2RU80 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
PtprbB2RU80 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
PtprbB2RU80 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PtprbB2RU80 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
PtprbB2RU80 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PtprbB2RU80 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PtprbB2RU80 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PtprbB2RU80 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PtprbB2RU80 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PtprbB2RU80 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
PtprbB2RU80 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PtprbB2RU80 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
PtprbB2RU80 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PtprbB2RU80 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PtprbB2RU80 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
PtprbB2RU80 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PtprbB2RU80 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PtprbB2RU80 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PtprbB2RU80 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PtprbB2RU80 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PtprbB2RU80 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PtprbB2RU80 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PtprbB2RU80 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PtprbB2RU80 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PtprbB2RU80 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PtprbB2RU80 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PtprbB2RU80 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
PtprbB2RU80 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
PtprbB2RU80 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
PtprbB2RU80 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
PtprbB2RU80 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
PtprbB2RU80 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
PtprbB2RU80 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PtprbB2RU80 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC12.17□□□□□ -0.46
PtprbB2RU80 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PtprbB2RU80 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PtprbB2RU80 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PtprbB2RU80 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PtprbB2RU80 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PtprbB2RU80 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PtprbB2RU80 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PtprbB2RU80 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PtprbB2RU80 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PtprbB2RU80 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
PtprbB2RU80 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PtprbB2RU80 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PtprbB2RU80 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PtprbB2RU80 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PtprbB2RU80 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PtprbB2RU80 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PtprbB2RU80 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
PtprbB2RU80 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PtprbB2RU80 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
PtprbB2RU80 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
PtprbB2RU80 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
PtprbB2RU80 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PtprbB2RU80 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PtprbB2RU80 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PtprbB2RU80 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
PtprbB2RU80 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
PtprbB2RU80 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
PtprbB2RU80 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
PtprbB2RU80 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PtprbB2RU80 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PtprbB2RU80 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
PtprbB2RU80 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
PtprbB2RU80 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
PtprbB2RU80 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PtprbB2RU80 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PtprbB2RU80 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
PtprbB2RU80 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PtprbB2RU80 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
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