Protein–RNA interactions for Protein: B2RQC2

Usp42, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 42, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp42B2RQC2 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp42B2RQC2 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp42B2RQC2 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp42B2RQC2 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp42B2RQC2 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp42B2RQC2 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp42B2RQC2 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp42B2RQC2 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp42B2RQC2 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp42B2RQC2 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp42B2RQC2 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp42B2RQC2 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp42B2RQC2 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp42B2RQC2 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp42B2RQC2 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp42B2RQC2 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp42B2RQC2 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp42B2RQC2 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp42B2RQC2 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp42B2RQC2 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp42B2RQC2 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp42B2RQC2 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp42B2RQC2 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp42B2RQC2 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp42B2RQC2 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp42B2RQC2 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp42B2RQC2 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp42B2RQC2 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp42B2RQC2 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Usp42B2RQC2 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Usp42B2RQC2 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Usp42B2RQC2 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Usp42B2RQC2 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Usp42B2RQC2 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Usp42B2RQC2 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Usp42B2RQC2 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Usp42B2RQC2 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Usp42B2RQC2 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp42B2RQC2 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp42B2RQC2 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp42B2RQC2 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp42B2RQC2 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp42B2RQC2 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp42B2RQC2 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp42B2RQC2 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp42B2RQC2 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp42B2RQC2 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp42B2RQC2 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp42B2RQC2 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp42B2RQC2 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp42B2RQC2 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp42B2RQC2 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp42B2RQC2 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp42B2RQC2 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp42B2RQC2 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp42B2RQC2 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp42B2RQC2 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp42B2RQC2 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp42B2RQC2 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp42B2RQC2 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp42B2RQC2 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp42B2RQC2 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp42B2RQC2 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp42B2RQC2 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp42B2RQC2 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp42B2RQC2 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp42B2RQC2 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp42B2RQC2 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp42B2RQC2 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp42B2RQC2 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp42B2RQC2 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp42B2RQC2 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp42B2RQC2 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp42B2RQC2 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp42B2RQC2 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp42B2RQC2 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp42B2RQC2 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp42B2RQC2 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp42B2RQC2 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp42B2RQC2 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp42B2RQC2 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp42B2RQC2 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp42B2RQC2 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp42B2RQC2 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp42B2RQC2 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp42B2RQC2 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp42B2RQC2 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp42B2RQC2 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp42B2RQC2 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp42B2RQC2 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp42B2RQC2 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp42B2RQC2 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp42B2RQC2 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp42B2RQC2 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp42B2RQC2 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp42B2RQC2 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp42B2RQC2 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp42B2RQC2 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp42B2RQC2 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp42B2RQC2 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms