Protein–RNA interactions for Protein: B2KF05

Brpf3, Bromodomain and PHD finger-containing, 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf3B2KF05 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Brpf3B2KF05 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Brpf3B2KF05 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Brpf3B2KF05 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Brpf3B2KF05 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Brpf3B2KF05 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Brpf3B2KF05 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Brpf3B2KF05 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Brpf3B2KF05 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Brpf3B2KF05 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Brpf3B2KF05 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Brpf3B2KF05 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Brpf3B2KF05 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Brpf3B2KF05 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Brpf3B2KF05 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Brpf3B2KF05 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Brpf3B2KF05 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Brpf3B2KF05 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Brpf3B2KF05 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Brpf3B2KF05 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Brpf3B2KF05 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Brpf3B2KF05 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Brpf3B2KF05 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Brpf3B2KF05 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Brpf3B2KF05 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Brpf3B2KF05 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Brpf3B2KF05 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Brpf3B2KF05 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Brpf3B2KF05 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Brpf3B2KF05 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Brpf3B2KF05 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Brpf3B2KF05 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Brpf3B2KF05 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Brpf3B2KF05 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Brpf3B2KF05 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Brpf3B2KF05 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Brpf3B2KF05 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Brpf3B2KF05 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Brpf3B2KF05 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Brpf3B2KF05 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Brpf3B2KF05 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Brpf3B2KF05 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Brpf3B2KF05 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Brpf3B2KF05 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Brpf3B2KF05 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Brpf3B2KF05 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Brpf3B2KF05 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Brpf3B2KF05 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Brpf3B2KF05 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Brpf3B2KF05 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Brpf3B2KF05 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Brpf3B2KF05 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Brpf3B2KF05 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Brpf3B2KF05 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Brpf3B2KF05 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Brpf3B2KF05 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Brpf3B2KF05 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Brpf3B2KF05 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Brpf3B2KF05 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Brpf3B2KF05 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Brpf3B2KF05 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Brpf3B2KF05 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Brpf3B2KF05 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Brpf3B2KF05 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Brpf3B2KF05 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Brpf3B2KF05 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Brpf3B2KF05 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Brpf3B2KF05 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Brpf3B2KF05 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Brpf3B2KF05 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Brpf3B2KF05 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Brpf3B2KF05 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Brpf3B2KF05 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Brpf3B2KF05 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Brpf3B2KF05 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Brpf3B2KF05 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Brpf3B2KF05 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Brpf3B2KF05 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Brpf3B2KF05 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Brpf3B2KF05 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Brpf3B2KF05 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Brpf3B2KF05 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Brpf3B2KF05 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Brpf3B2KF05 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Brpf3B2KF05 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Brpf3B2KF05 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Brpf3B2KF05 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Brpf3B2KF05 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Brpf3B2KF05 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Brpf3B2KF05 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Brpf3B2KF05 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Brpf3B2KF05 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Brpf3B2KF05 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Brpf3B2KF05 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Brpf3B2KF05 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Brpf3B2KF05 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Brpf3B2KF05 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Brpf3B2KF05 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Brpf3B2KF05 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Brpf3B2KF05 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms