Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

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Length 919 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Grik3B1AS29 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Grik3B1AS29 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Grik3B1AS29 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Grik3B1AS29 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Grik3B1AS29 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Grik3B1AS29 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Grik3B1AS29 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Grik3B1AS29 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Grik3B1AS29 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Grik3B1AS29 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Grik3B1AS29 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Grik3B1AS29 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Grik3B1AS29 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Grik3B1AS29 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Grik3B1AS29 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Grik3B1AS29 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Grik3B1AS29 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Grik3B1AS29 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Grik3B1AS29 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Grik3B1AS29 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Grik3B1AS29 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Grik3B1AS29 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Grik3B1AS29 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Grik3B1AS29 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Grik3B1AS29 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Grik3B1AS29 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Grik3B1AS29 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Grik3B1AS29 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Grik3B1AS29 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Grik3B1AS29 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Grik3B1AS29 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Grik3B1AS29 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Grik3B1AS29 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Grik3B1AS29 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Grik3B1AS29 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Grik3B1AS29 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Grik3B1AS29 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Grik3B1AS29 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Grik3B1AS29 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Grik3B1AS29 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Grik3B1AS29 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Grik3B1AS29 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Grik3B1AS29 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Grik3B1AS29 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Grik3B1AS29 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Grik3B1AS29 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Grik3B1AS29 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Grik3B1AS29 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Grik3B1AS29 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Grik3B1AS29 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Grik3B1AS29 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Grik3B1AS29 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Grik3B1AS29 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Grik3B1AS29 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Grik3B1AS29 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Grik3B1AS29 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Grik3B1AS29 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Grik3B1AS29 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Grik3B1AS29 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Grik3B1AS29 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Grik3B1AS29 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Grik3B1AS29 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Grik3B1AS29 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Grik3B1AS29 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Grik3B1AS29 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Grik3B1AS29 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Grik3B1AS29 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Grik3B1AS29 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Grik3B1AS29 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Grik3B1AS29 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Grik3B1AS29 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Grik3B1AS29 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Grik3B1AS29 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Grik3B1AS29 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Grik3B1AS29 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Grik3B1AS29 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Grik3B1AS29 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Grik3B1AS29 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Grik3B1AS29 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Grik3B1AS29 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Grik3B1AS29 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Grik3B1AS29 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Grik3B1AS29 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Grik3B1AS29 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Grik3B1AS29 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Grik3B1AS29 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Grik3B1AS29 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Grik3B1AS29 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Grik3B1AS29 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Grik3B1AS29 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Grik3B1AS29 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Grik3B1AS29 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Grik3B1AS29 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Grik3B1AS29 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Grik3B1AS29 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Grik3B1AS29 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Grik3B1AS29 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Grik3B1AS29 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Grik3B1AS29 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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