Protein–RNA interactions for Protein: A4UUI3

Gbp4, Guanylate binding protein 4.1, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp4A4UUI3 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gbp4A4UUI3 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gbp4A4UUI3 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gbp4A4UUI3 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gbp4A4UUI3 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gbp4A4UUI3 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gbp4A4UUI3 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gbp4A4UUI3 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Gbp4A4UUI3 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gbp4A4UUI3 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gbp4A4UUI3 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gbp4A4UUI3 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gbp4A4UUI3 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gbp4A4UUI3 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gbp4A4UUI3 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gbp4A4UUI3 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gbp4A4UUI3 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gbp4A4UUI3 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gbp4A4UUI3 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gbp4A4UUI3 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gbp4A4UUI3 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gbp4A4UUI3 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gbp4A4UUI3 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gbp4A4UUI3 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gbp4A4UUI3 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gbp4A4UUI3 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Gbp4A4UUI3 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gbp4A4UUI3 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gbp4A4UUI3 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gbp4A4UUI3 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gbp4A4UUI3 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Gbp4A4UUI3 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Gbp4A4UUI3 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gbp4A4UUI3 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Gbp4A4UUI3 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gbp4A4UUI3 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gbp4A4UUI3 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gbp4A4UUI3 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gbp4A4UUI3 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gbp4A4UUI3 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gbp4A4UUI3 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gbp4A4UUI3 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Gbp4A4UUI3 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gbp4A4UUI3 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gbp4A4UUI3 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gbp4A4UUI3 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gbp4A4UUI3 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gbp4A4UUI3 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gbp4A4UUI3 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gbp4A4UUI3 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Gbp4A4UUI3 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Gbp4A4UUI3 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Gbp4A4UUI3 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gbp4A4UUI3 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gbp4A4UUI3 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gbp4A4UUI3 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gbp4A4UUI3 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gbp4A4UUI3 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gbp4A4UUI3 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gbp4A4UUI3 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gbp4A4UUI3 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gbp4A4UUI3 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gbp4A4UUI3 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gbp4A4UUI3 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Gbp4A4UUI3 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gbp4A4UUI3 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gbp4A4UUI3 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gbp4A4UUI3 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gbp4A4UUI3 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gbp4A4UUI3 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gbp4A4UUI3 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gbp4A4UUI3 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gbp4A4UUI3 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Gbp4A4UUI3 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gbp4A4UUI3 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Gbp4A4UUI3 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gbp4A4UUI3 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gbp4A4UUI3 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gbp4A4UUI3 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gbp4A4UUI3 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gbp4A4UUI3 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gbp4A4UUI3 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gbp4A4UUI3 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gbp4A4UUI3 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gbp4A4UUI3 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gbp4A4UUI3 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gbp4A4UUI3 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gbp4A4UUI3 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Gbp4A4UUI3 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gbp4A4UUI3 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gbp4A4UUI3 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gbp4A4UUI3 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gbp4A4UUI3 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gbp4A4UUI3 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Gbp4A4UUI3 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gbp4A4UUI3 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gbp4A4UUI3 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gbp4A4UUI3 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gbp4A4UUI3 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gbp4A4UUI3 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms