Protein–RNA interactions for Protein: A3KGV1

Odf2, Outer dense fiber protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2A3KGV1 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Odf2A3KGV1 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Odf2A3KGV1 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Odf2A3KGV1 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Odf2A3KGV1 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Odf2A3KGV1 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Odf2A3KGV1 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Odf2A3KGV1 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Odf2A3KGV1 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Odf2A3KGV1 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Odf2A3KGV1 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Odf2A3KGV1 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Odf2A3KGV1 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Odf2A3KGV1 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Odf2A3KGV1 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Odf2A3KGV1 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Odf2A3KGV1 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Odf2A3KGV1 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Odf2A3KGV1 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Odf2A3KGV1 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Odf2A3KGV1 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Odf2A3KGV1 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Odf2A3KGV1 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Odf2A3KGV1 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Odf2A3KGV1 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Odf2A3KGV1 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Odf2A3KGV1 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Odf2A3KGV1 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Odf2A3KGV1 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Odf2A3KGV1 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Odf2A3KGV1 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Odf2A3KGV1 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Odf2A3KGV1 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Odf2A3KGV1 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Odf2A3KGV1 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Odf2A3KGV1 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Odf2A3KGV1 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Odf2A3KGV1 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Odf2A3KGV1 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Odf2A3KGV1 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Odf2A3KGV1 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Odf2A3KGV1 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Odf2A3KGV1 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Odf2A3KGV1 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Odf2A3KGV1 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Odf2A3KGV1 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Odf2A3KGV1 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Odf2A3KGV1 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Odf2A3KGV1 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Odf2A3KGV1 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Odf2A3KGV1 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Odf2A3KGV1 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Odf2A3KGV1 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Odf2A3KGV1 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Odf2A3KGV1 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Odf2A3KGV1 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Odf2A3KGV1 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Odf2A3KGV1 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Odf2A3KGV1 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Odf2A3KGV1 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Odf2A3KGV1 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Odf2A3KGV1 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Odf2A3KGV1 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Odf2A3KGV1 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Odf2A3KGV1 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Odf2A3KGV1 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Odf2A3KGV1 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Odf2A3KGV1 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Odf2A3KGV1 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Odf2A3KGV1 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Odf2A3KGV1 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Odf2A3KGV1 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Odf2A3KGV1 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Odf2A3KGV1 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Odf2A3KGV1 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Odf2A3KGV1 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Odf2A3KGV1 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Odf2A3KGV1 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Odf2A3KGV1 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Odf2A3KGV1 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Odf2A3KGV1 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Odf2A3KGV1 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Odf2A3KGV1 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Odf2A3KGV1 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Odf2A3KGV1 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Odf2A3KGV1 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Odf2A3KGV1 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Odf2A3KGV1 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Odf2A3KGV1 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Odf2A3KGV1 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Odf2A3KGV1 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Odf2A3KGV1 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Odf2A3KGV1 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Odf2A3KGV1 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Odf2A3KGV1 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Odf2A3KGV1 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Odf2A3KGV1 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Odf2A3KGV1 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Odf2A3KGV1 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Odf2A3KGV1 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms