Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Rtf1A2AQ19 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Rtf1A2AQ19 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rtf1A2AQ19 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rtf1A2AQ19 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rtf1A2AQ19 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rtf1A2AQ19 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rtf1A2AQ19 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rtf1A2AQ19 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rtf1A2AQ19 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rtf1A2AQ19 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rtf1A2AQ19 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rtf1A2AQ19 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rtf1A2AQ19 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rtf1A2AQ19 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rtf1A2AQ19 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rtf1A2AQ19 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rtf1A2AQ19 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rtf1A2AQ19 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rtf1A2AQ19 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Rtf1A2AQ19 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rtf1A2AQ19 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rtf1A2AQ19 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Rtf1A2AQ19 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rtf1A2AQ19 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Rtf1A2AQ19 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rtf1A2AQ19 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rtf1A2AQ19 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rtf1A2AQ19 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rtf1A2AQ19 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rtf1A2AQ19 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rtf1A2AQ19 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rtf1A2AQ19 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rtf1A2AQ19 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rtf1A2AQ19 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rtf1A2AQ19 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rtf1A2AQ19 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rtf1A2AQ19 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rtf1A2AQ19 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rtf1A2AQ19 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rtf1A2AQ19 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rtf1A2AQ19 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rtf1A2AQ19 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
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Rtf1A2AQ19 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rtf1A2AQ19 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rtf1A2AQ19 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
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Rtf1A2AQ19 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rtf1A2AQ19 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rtf1A2AQ19 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rtf1A2AQ19 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rtf1A2AQ19 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rtf1A2AQ19 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
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Rtf1A2AQ19 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rtf1A2AQ19 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rtf1A2AQ19 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
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Rtf1A2AQ19 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
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Rtf1A2AQ19 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rtf1A2AQ19 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rtf1A2AQ19 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rtf1A2AQ19 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rtf1A2AQ19 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rtf1A2AQ19 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
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Rtf1A2AQ19 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rtf1A2AQ19 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rtf1A2AQ19 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Rtf1A2AQ19 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rtf1A2AQ19 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rtf1A2AQ19 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rtf1A2AQ19 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rtf1A2AQ19 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rtf1A2AQ19 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rtf1A2AQ19 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rtf1A2AQ19 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rtf1A2AQ19 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rtf1A2AQ19 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rtf1A2AQ19 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rtf1A2AQ19 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rtf1A2AQ19 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
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