Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

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Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
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