Protein–RNA interactions for Protein: A2AKB4

Frmpd1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd1A2AKB4 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Frmpd1A2AKB4 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Frmpd1A2AKB4 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Frmpd1A2AKB4 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Frmpd1A2AKB4 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Frmpd1A2AKB4 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Frmpd1A2AKB4 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Frmpd1A2AKB4 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Frmpd1A2AKB4 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Frmpd1A2AKB4 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Frmpd1A2AKB4 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Frmpd1A2AKB4 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Frmpd1A2AKB4 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Frmpd1A2AKB4 AC136986.1-201ENSMUST00000222829 380 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Frmpd1A2AKB4 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Frmpd1A2AKB4 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Frmpd1A2AKB4 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Frmpd1A2AKB4 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Frmpd1A2AKB4 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Frmpd1A2AKB4 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Frmpd1A2AKB4 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Frmpd1A2AKB4 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Frmpd1A2AKB4 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Frmpd1A2AKB4 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Frmpd1A2AKB4 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Frmpd1A2AKB4 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Frmpd1A2AKB4 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Frmpd1A2AKB4 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Frmpd1A2AKB4 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Frmpd1A2AKB4 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Frmpd1A2AKB4 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Frmpd1A2AKB4 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Frmpd1A2AKB4 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Frmpd1A2AKB4 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Frmpd1A2AKB4 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Frmpd1A2AKB4 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Frmpd1A2AKB4 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Frmpd1A2AKB4 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Frmpd1A2AKB4 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Frmpd1A2AKB4 Snhg8-201ENSMUST00000196466 448 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Frmpd1A2AKB4 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Frmpd1A2AKB4 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Frmpd1A2AKB4 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Frmpd1A2AKB4 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Frmpd1A2AKB4 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Frmpd1A2AKB4 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Frmpd1A2AKB4 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Frmpd1A2AKB4 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Frmpd1A2AKB4 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Frmpd1A2AKB4 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Frmpd1A2AKB4 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Frmpd1A2AKB4 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Frmpd1A2AKB4 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Frmpd1A2AKB4 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Frmpd1A2AKB4 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Frmpd1A2AKB4 4931419H13Rik-201ENSMUST00000199770 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Frmpd1A2AKB4 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Frmpd1A2AKB4 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Frmpd1A2AKB4 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Frmpd1A2AKB4 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Frmpd1A2AKB4 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Frmpd1A2AKB4 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Frmpd1A2AKB4 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Frmpd1A2AKB4 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Frmpd1A2AKB4 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Frmpd1A2AKB4 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Frmpd1A2AKB4 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Frmpd1A2AKB4 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Frmpd1A2AKB4 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Frmpd1A2AKB4 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Frmpd1A2AKB4 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Frmpd1A2AKB4 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Frmpd1A2AKB4 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Frmpd1A2AKB4 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Frmpd1A2AKB4 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Frmpd1A2AKB4 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Frmpd1A2AKB4 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Frmpd1A2AKB4 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Frmpd1A2AKB4 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Frmpd1A2AKB4 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Frmpd1A2AKB4 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Frmpd1A2AKB4 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Frmpd1A2AKB4 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Frmpd1A2AKB4 Trpm2-201ENSMUST00000105399 731 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Frmpd1A2AKB4 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Frmpd1A2AKB4 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Frmpd1A2AKB4 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Frmpd1A2AKB4 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Frmpd1A2AKB4 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Frmpd1A2AKB4 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Frmpd1A2AKB4 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Frmpd1A2AKB4 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Frmpd1A2AKB4 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Frmpd1A2AKB4 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Frmpd1A2AKB4 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Frmpd1A2AKB4 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Frmpd1A2AKB4 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Frmpd1A2AKB4 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Frmpd1A2AKB4 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Frmpd1A2AKB4 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms