Protein–RNA interactions for Protein: A2AH22

Ambra1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ambra1A2AH22 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ambra1A2AH22 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ambra1A2AH22 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ambra1A2AH22 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ambra1A2AH22 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ambra1A2AH22 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ambra1A2AH22 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ambra1A2AH22 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ambra1A2AH22 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ambra1A2AH22 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ambra1A2AH22 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ambra1A2AH22 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ambra1A2AH22 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ambra1A2AH22 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ambra1A2AH22 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ambra1A2AH22 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ambra1A2AH22 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ambra1A2AH22 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ambra1A2AH22 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ambra1A2AH22 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ambra1A2AH22 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ambra1A2AH22 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ambra1A2AH22 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ambra1A2AH22 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ambra1A2AH22 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ambra1A2AH22 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ambra1A2AH22 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ambra1A2AH22 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ambra1A2AH22 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ambra1A2AH22 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ambra1A2AH22 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ambra1A2AH22 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ambra1A2AH22 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ambra1A2AH22 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ambra1A2AH22 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ambra1A2AH22 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ambra1A2AH22 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ambra1A2AH22 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ambra1A2AH22 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ambra1A2AH22 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ambra1A2AH22 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ambra1A2AH22 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ambra1A2AH22 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ambra1A2AH22 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ambra1A2AH22 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ambra1A2AH22 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ambra1A2AH22 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ambra1A2AH22 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ambra1A2AH22 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ambra1A2AH22 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ambra1A2AH22 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ambra1A2AH22 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ambra1A2AH22 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ambra1A2AH22 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ambra1A2AH22 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ambra1A2AH22 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ambra1A2AH22 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ambra1A2AH22 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ambra1A2AH22 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ambra1A2AH22 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ambra1A2AH22 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ambra1A2AH22 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ambra1A2AH22 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ambra1A2AH22 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ambra1A2AH22 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ambra1A2AH22 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ambra1A2AH22 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ambra1A2AH22 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ambra1A2AH22 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ambra1A2AH22 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ambra1A2AH22 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ambra1A2AH22 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ambra1A2AH22 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ambra1A2AH22 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ambra1A2AH22 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ambra1A2AH22 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ambra1A2AH22 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ambra1A2AH22 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ambra1A2AH22 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ambra1A2AH22 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ambra1A2AH22 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ambra1A2AH22 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ambra1A2AH22 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ambra1A2AH22 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ambra1A2AH22 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ambra1A2AH22 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ambra1A2AH22 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ambra1A2AH22 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ambra1A2AH22 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ambra1A2AH22 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ambra1A2AH22 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ambra1A2AH22 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ambra1A2AH22 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ambra1A2AH22 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ambra1A2AH22 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ambra1A2AH22 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ambra1A2AH22 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ambra1A2AH22 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ambra1A2AH22 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ambra1A2AH22 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms