Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.04□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC8.04□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC8.04□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC8.04□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC8.04□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.03□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC8.03□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC8.03□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.03□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms