Protein–RNA interactions for Protein: T1NXB5

Vstm4, V-set and transmembrane domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm4T1NXB5 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Vstm4T1NXB5 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Vstm4T1NXB5 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Vstm4T1NXB5 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Vstm4T1NXB5 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Vstm4T1NXB5 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Vstm4T1NXB5 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Vstm4T1NXB5 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Vstm4T1NXB5 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Vstm4T1NXB5 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Vstm4T1NXB5 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Vstm4T1NXB5 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Vstm4T1NXB5 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Vstm4T1NXB5 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Vstm4T1NXB5 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Vstm4T1NXB5 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Vstm4T1NXB5 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Vstm4T1NXB5 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Vstm4T1NXB5 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Vstm4T1NXB5 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Vstm4T1NXB5 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Vstm4T1NXB5 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Vstm4T1NXB5 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Vstm4T1NXB5 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Vstm4T1NXB5 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Vstm4T1NXB5 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Vstm4T1NXB5 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Vstm4T1NXB5 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Vstm4T1NXB5 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Vstm4T1NXB5 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Vstm4T1NXB5 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Vstm4T1NXB5 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Vstm4T1NXB5 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Vstm4T1NXB5 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Vstm4T1NXB5 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Vstm4T1NXB5 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vstm4T1NXB5 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vstm4T1NXB5 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vstm4T1NXB5 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vstm4T1NXB5 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vstm4T1NXB5 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vstm4T1NXB5 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vstm4T1NXB5 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vstm4T1NXB5 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vstm4T1NXB5 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vstm4T1NXB5 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vstm4T1NXB5 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vstm4T1NXB5 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vstm4T1NXB5 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vstm4T1NXB5 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Vstm4T1NXB5 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Vstm4T1NXB5 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vstm4T1NXB5 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vstm4T1NXB5 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vstm4T1NXB5 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vstm4T1NXB5 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vstm4T1NXB5 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vstm4T1NXB5 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vstm4T1NXB5 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vstm4T1NXB5 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Vstm4T1NXB5 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vstm4T1NXB5 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vstm4T1NXB5 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vstm4T1NXB5 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vstm4T1NXB5 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Vstm4T1NXB5 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vstm4T1NXB5 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vstm4T1NXB5 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vstm4T1NXB5 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vstm4T1NXB5 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vstm4T1NXB5 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vstm4T1NXB5 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vstm4T1NXB5 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vstm4T1NXB5 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vstm4T1NXB5 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vstm4T1NXB5 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vstm4T1NXB5 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vstm4T1NXB5 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vstm4T1NXB5 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vstm4T1NXB5 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vstm4T1NXB5 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vstm4T1NXB5 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vstm4T1NXB5 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vstm4T1NXB5 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vstm4T1NXB5 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vstm4T1NXB5 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vstm4T1NXB5 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Vstm4T1NXB5 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Vstm4T1NXB5 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Vstm4T1NXB5 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vstm4T1NXB5 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vstm4T1NXB5 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vstm4T1NXB5 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vstm4T1NXB5 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vstm4T1NXB5 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vstm4T1NXB5 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vstm4T1NXB5 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vstm4T1NXB5 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Vstm4T1NXB5 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vstm4T1NXB5 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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