Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Y3

Homer1, Homer protein homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer1Q9Z2Y3 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Homer1Q9Z2Y3 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Homer1Q9Z2Y3 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Homer1Q9Z2Y3 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Homer1Q9Z2Y3 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Homer1Q9Z2Y3 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Homer1Q9Z2Y3 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Homer1Q9Z2Y3 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Homer1Q9Z2Y3 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Homer1Q9Z2Y3 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Homer1Q9Z2Y3 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Homer1Q9Z2Y3 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Homer1Q9Z2Y3 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Homer1Q9Z2Y3 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Homer1Q9Z2Y3 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Homer1Q9Z2Y3 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Homer1Q9Z2Y3 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Homer1Q9Z2Y3 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Homer1Q9Z2Y3 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Homer1Q9Z2Y3 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Homer1Q9Z2Y3 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Homer1Q9Z2Y3 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Homer1Q9Z2Y3 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Homer1Q9Z2Y3 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Homer1Q9Z2Y3 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Homer1Q9Z2Y3 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Homer1Q9Z2Y3 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Homer1Q9Z2Y3 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Homer1Q9Z2Y3 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Homer1Q9Z2Y3 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Homer1Q9Z2Y3 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Homer1Q9Z2Y3 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Homer1Q9Z2Y3 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Homer1Q9Z2Y3 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Homer1Q9Z2Y3 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Homer1Q9Z2Y3 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Homer1Q9Z2Y3 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Homer1Q9Z2Y3 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Homer1Q9Z2Y3 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Homer1Q9Z2Y3 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Homer1Q9Z2Y3 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Homer1Q9Z2Y3 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Homer1Q9Z2Y3 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Homer1Q9Z2Y3 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Homer1Q9Z2Y3 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Homer1Q9Z2Y3 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Homer1Q9Z2Y3 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Homer1Q9Z2Y3 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Homer1Q9Z2Y3 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Homer1Q9Z2Y3 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Homer1Q9Z2Y3 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Homer1Q9Z2Y3 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Homer1Q9Z2Y3 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Homer1Q9Z2Y3 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Homer1Q9Z2Y3 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Homer1Q9Z2Y3 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Homer1Q9Z2Y3 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Homer1Q9Z2Y3 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Homer1Q9Z2Y3 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Homer1Q9Z2Y3 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Homer1Q9Z2Y3 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Homer1Q9Z2Y3 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Homer1Q9Z2Y3 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Homer1Q9Z2Y3 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Homer1Q9Z2Y3 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Homer1Q9Z2Y3 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Homer1Q9Z2Y3 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Homer1Q9Z2Y3 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Homer1Q9Z2Y3 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Homer1Q9Z2Y3 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Homer1Q9Z2Y3 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Homer1Q9Z2Y3 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Homer1Q9Z2Y3 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Homer1Q9Z2Y3 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Homer1Q9Z2Y3 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Homer1Q9Z2Y3 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Homer1Q9Z2Y3 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Homer1Q9Z2Y3 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Homer1Q9Z2Y3 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Homer1Q9Z2Y3 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Homer1Q9Z2Y3 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Homer1Q9Z2Y3 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Homer1Q9Z2Y3 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Homer1Q9Z2Y3 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Homer1Q9Z2Y3 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Homer1Q9Z2Y3 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Homer1Q9Z2Y3 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Homer1Q9Z2Y3 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Homer1Q9Z2Y3 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Homer1Q9Z2Y3 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Homer1Q9Z2Y3 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Homer1Q9Z2Y3 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Homer1Q9Z2Y3 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Homer1Q9Z2Y3 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Homer1Q9Z2Y3 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Homer1Q9Z2Y3 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Homer1Q9Z2Y3 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Homer1Q9Z2Y3 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Homer1Q9Z2Y3 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Homer1Q9Z2Y3 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms