Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q5

Mrpl40, 39S ribosomal protein L40, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl40Q9Z2Q5 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Mrpl40Q9Z2Q5 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Mrpl40Q9Z2Q5 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Mrpl40Q9Z2Q5 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Mrpl40Q9Z2Q5 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Mrpl40Q9Z2Q5 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Mrpl40Q9Z2Q5 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Mrpl40Q9Z2Q5 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Mrpl40Q9Z2Q5 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Mrpl40Q9Z2Q5 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Mrpl40Q9Z2Q5 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Mrpl40Q9Z2Q5 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Mrpl40Q9Z2Q5 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Mrpl40Q9Z2Q5 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Mrpl40Q9Z2Q5 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Mrpl40Q9Z2Q5 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Mrpl40Q9Z2Q5 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Mrpl40Q9Z2Q5 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Mrpl40Q9Z2Q5 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Mrpl40Q9Z2Q5 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Mrpl40Q9Z2Q5 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Mrpl40Q9Z2Q5 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Mrpl40Q9Z2Q5 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Mrpl40Q9Z2Q5 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Mrpl40Q9Z2Q5 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Mrpl40Q9Z2Q5 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Mrpl40Q9Z2Q5 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Mrpl40Q9Z2Q5 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Mrpl40Q9Z2Q5 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Mrpl40Q9Z2Q5 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Mrpl40Q9Z2Q5 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Mrpl40Q9Z2Q5 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Mrpl40Q9Z2Q5 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Mrpl40Q9Z2Q5 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Mrpl40Q9Z2Q5 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Mrpl40Q9Z2Q5 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Mrpl40Q9Z2Q5 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Mrpl40Q9Z2Q5 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Mrpl40Q9Z2Q5 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Mrpl40Q9Z2Q5 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Mrpl40Q9Z2Q5 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Mrpl40Q9Z2Q5 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Mrpl40Q9Z2Q5 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Mrpl40Q9Z2Q5 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Mrpl40Q9Z2Q5 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Mrpl40Q9Z2Q5 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Mrpl40Q9Z2Q5 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Mrpl40Q9Z2Q5 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Mrpl40Q9Z2Q5 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Mrpl40Q9Z2Q5 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Mrpl40Q9Z2Q5 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Mrpl40Q9Z2Q5 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Mrpl40Q9Z2Q5 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Mrpl40Q9Z2Q5 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Mrpl40Q9Z2Q5 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Mrpl40Q9Z2Q5 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Mrpl40Q9Z2Q5 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Mrpl40Q9Z2Q5 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Mrpl40Q9Z2Q5 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Mrpl40Q9Z2Q5 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Mrpl40Q9Z2Q5 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Mrpl40Q9Z2Q5 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Mrpl40Q9Z2Q5 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Mrpl40Q9Z2Q5 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Mrpl40Q9Z2Q5 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Mrpl40Q9Z2Q5 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Mrpl40Q9Z2Q5 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Mrpl40Q9Z2Q5 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Mrpl40Q9Z2Q5 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Mrpl40Q9Z2Q5 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Mrpl40Q9Z2Q5 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Mrpl40Q9Z2Q5 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Mrpl40Q9Z2Q5 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Mrpl40Q9Z2Q5 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Mrpl40Q9Z2Q5 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Mrpl40Q9Z2Q5 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Mrpl40Q9Z2Q5 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Mrpl40Q9Z2Q5 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Mrpl40Q9Z2Q5 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Mrpl40Q9Z2Q5 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Mrpl40Q9Z2Q5 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Mrpl40Q9Z2Q5 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Mrpl40Q9Z2Q5 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Mrpl40Q9Z2Q5 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Mrpl40Q9Z2Q5 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Mrpl40Q9Z2Q5 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Mrpl40Q9Z2Q5 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Mrpl40Q9Z2Q5 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms