Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Y4

Trip6, Thyroid receptor-interacting protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip6Q9Z1Y4 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trip6Q9Z1Y4 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trip6Q9Z1Y4 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trip6Q9Z1Y4 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trip6Q9Z1Y4 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trip6Q9Z1Y4 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trip6Q9Z1Y4 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trip6Q9Z1Y4 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Trip6Q9Z1Y4 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trip6Q9Z1Y4 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trip6Q9Z1Y4 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trip6Q9Z1Y4 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trip6Q9Z1Y4 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trip6Q9Z1Y4 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trip6Q9Z1Y4 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trip6Q9Z1Y4 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trip6Q9Z1Y4 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trip6Q9Z1Y4 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trip6Q9Z1Y4 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trip6Q9Z1Y4 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Trip6Q9Z1Y4 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trip6Q9Z1Y4 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trip6Q9Z1Y4 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trip6Q9Z1Y4 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trip6Q9Z1Y4 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trip6Q9Z1Y4 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trip6Q9Z1Y4 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trip6Q9Z1Y4 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trip6Q9Z1Y4 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trip6Q9Z1Y4 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trip6Q9Z1Y4 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trip6Q9Z1Y4 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trip6Q9Z1Y4 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trip6Q9Z1Y4 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trip6Q9Z1Y4 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trip6Q9Z1Y4 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trip6Q9Z1Y4 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trip6Q9Z1Y4 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trip6Q9Z1Y4 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Trip6Q9Z1Y4 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Trip6Q9Z1Y4 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trip6Q9Z1Y4 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trip6Q9Z1Y4 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trip6Q9Z1Y4 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Trip6Q9Z1Y4 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trip6Q9Z1Y4 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trip6Q9Z1Y4 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trip6Q9Z1Y4 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trip6Q9Z1Y4 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trip6Q9Z1Y4 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trip6Q9Z1Y4 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trip6Q9Z1Y4 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trip6Q9Z1Y4 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trip6Q9Z1Y4 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trip6Q9Z1Y4 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trip6Q9Z1Y4 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trip6Q9Z1Y4 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trip6Q9Z1Y4 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trip6Q9Z1Y4 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trip6Q9Z1Y4 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trip6Q9Z1Y4 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trip6Q9Z1Y4 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trip6Q9Z1Y4 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Trip6Q9Z1Y4 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trip6Q9Z1Y4 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trip6Q9Z1Y4 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trip6Q9Z1Y4 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Trip6Q9Z1Y4 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Trip6Q9Z1Y4 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Trip6Q9Z1Y4 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Trip6Q9Z1Y4 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trip6Q9Z1Y4 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trip6Q9Z1Y4 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Trip6Q9Z1Y4 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Trip6Q9Z1Y4 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trip6Q9Z1Y4 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trip6Q9Z1Y4 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trip6Q9Z1Y4 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trip6Q9Z1Y4 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trip6Q9Z1Y4 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trip6Q9Z1Y4 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trip6Q9Z1Y4 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trip6Q9Z1Y4 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trip6Q9Z1Y4 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trip6Q9Z1Y4 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trip6Q9Z1Y4 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trip6Q9Z1Y4 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trip6Q9Z1Y4 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trip6Q9Z1Y4 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trip6Q9Z1Y4 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trip6Q9Z1Y4 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trip6Q9Z1Y4 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trip6Q9Z1Y4 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trip6Q9Z1Y4 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trip6Q9Z1Y4 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trip6Q9Z1Y4 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trip6Q9Z1Y4 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trip6Q9Z1Y4 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trip6Q9Z1Y4 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trip6Q9Z1Y4 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.6 ms