Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1L2

Syngr4, Synaptogyrin-4, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr4Q9Z1L2 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Syngr4Q9Z1L2 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Syngr4Q9Z1L2 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Syngr4Q9Z1L2 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Syngr4Q9Z1L2 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Syngr4Q9Z1L2 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Syngr4Q9Z1L2 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Syngr4Q9Z1L2 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Syngr4Q9Z1L2 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Syngr4Q9Z1L2 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Syngr4Q9Z1L2 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Syngr4Q9Z1L2 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Syngr4Q9Z1L2 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Syngr4Q9Z1L2 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Syngr4Q9Z1L2 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Syngr4Q9Z1L2 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Syngr4Q9Z1L2 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Syngr4Q9Z1L2 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Syngr4Q9Z1L2 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Syngr4Q9Z1L2 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Syngr4Q9Z1L2 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Syngr4Q9Z1L2 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Syngr4Q9Z1L2 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Syngr4Q9Z1L2 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Syngr4Q9Z1L2 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Syngr4Q9Z1L2 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Syngr4Q9Z1L2 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Syngr4Q9Z1L2 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Syngr4Q9Z1L2 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Syngr4Q9Z1L2 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Syngr4Q9Z1L2 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Syngr4Q9Z1L2 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Syngr4Q9Z1L2 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Syngr4Q9Z1L2 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Syngr4Q9Z1L2 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Syngr4Q9Z1L2 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Syngr4Q9Z1L2 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Syngr4Q9Z1L2 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Syngr4Q9Z1L2 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Syngr4Q9Z1L2 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Syngr4Q9Z1L2 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Syngr4Q9Z1L2 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Syngr4Q9Z1L2 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Syngr4Q9Z1L2 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Syngr4Q9Z1L2 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Syngr4Q9Z1L2 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Syngr4Q9Z1L2 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Syngr4Q9Z1L2 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Syngr4Q9Z1L2 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Syngr4Q9Z1L2 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Syngr4Q9Z1L2 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Syngr4Q9Z1L2 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Syngr4Q9Z1L2 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Syngr4Q9Z1L2 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Syngr4Q9Z1L2 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Syngr4Q9Z1L2 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Syngr4Q9Z1L2 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Syngr4Q9Z1L2 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Syngr4Q9Z1L2 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Syngr4Q9Z1L2 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Syngr4Q9Z1L2 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Syngr4Q9Z1L2 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Syngr4Q9Z1L2 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Syngr4Q9Z1L2 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Syngr4Q9Z1L2 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Syngr4Q9Z1L2 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Syngr4Q9Z1L2 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Syngr4Q9Z1L2 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Syngr4Q9Z1L2 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Syngr4Q9Z1L2 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Syngr4Q9Z1L2 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Syngr4Q9Z1L2 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Syngr4Q9Z1L2 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Syngr4Q9Z1L2 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Syngr4Q9Z1L2 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Syngr4Q9Z1L2 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Syngr4Q9Z1L2 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Syngr4Q9Z1L2 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Syngr4Q9Z1L2 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Syngr4Q9Z1L2 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Syngr4Q9Z1L2 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Syngr4Q9Z1L2 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Syngr4Q9Z1L2 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Syngr4Q9Z1L2 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Syngr4Q9Z1L2 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Syngr4Q9Z1L2 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Syngr4Q9Z1L2 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Syngr4Q9Z1L2 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Syngr4Q9Z1L2 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Syngr4Q9Z1L2 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Syngr4Q9Z1L2 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Syngr4Q9Z1L2 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Syngr4Q9Z1L2 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Syngr4Q9Z1L2 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Syngr4Q9Z1L2 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Syngr4Q9Z1L2 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Syngr4Q9Z1L2 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Syngr4Q9Z1L2 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Syngr4Q9Z1L2 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Syngr4Q9Z1L2 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms