Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTM4

Nfe2l3, Nuclear factor erythroid 2-related factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfe2l3Q9WTM4 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nfe2l3Q9WTM4 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nfe2l3Q9WTM4 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nfe2l3Q9WTM4 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nfe2l3Q9WTM4 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nfe2l3Q9WTM4 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nfe2l3Q9WTM4 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nfe2l3Q9WTM4 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nfe2l3Q9WTM4 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nfe2l3Q9WTM4 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nfe2l3Q9WTM4 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Nfe2l3Q9WTM4 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nfe2l3Q9WTM4 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nfe2l3Q9WTM4 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nfe2l3Q9WTM4 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nfe2l3Q9WTM4 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nfe2l3Q9WTM4 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nfe2l3Q9WTM4 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nfe2l3Q9WTM4 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nfe2l3Q9WTM4 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Nfe2l3Q9WTM4 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Nfe2l3Q9WTM4 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Nfe2l3Q9WTM4 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nfe2l3Q9WTM4 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nfe2l3Q9WTM4 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Nfe2l3Q9WTM4 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nfe2l3Q9WTM4 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nfe2l3Q9WTM4 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nfe2l3Q9WTM4 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nfe2l3Q9WTM4 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nfe2l3Q9WTM4 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nfe2l3Q9WTM4 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nfe2l3Q9WTM4 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nfe2l3Q9WTM4 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nfe2l3Q9WTM4 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nfe2l3Q9WTM4 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nfe2l3Q9WTM4 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nfe2l3Q9WTM4 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Nfe2l3Q9WTM4 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nfe2l3Q9WTM4 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nfe2l3Q9WTM4 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Nfe2l3Q9WTM4 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nfe2l3Q9WTM4 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nfe2l3Q9WTM4 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nfe2l3Q9WTM4 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nfe2l3Q9WTM4 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Nfe2l3Q9WTM4 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nfe2l3Q9WTM4 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Nfe2l3Q9WTM4 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nfe2l3Q9WTM4 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nfe2l3Q9WTM4 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nfe2l3Q9WTM4 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Nfe2l3Q9WTM4 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nfe2l3Q9WTM4 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nfe2l3Q9WTM4 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nfe2l3Q9WTM4 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nfe2l3Q9WTM4 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nfe2l3Q9WTM4 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nfe2l3Q9WTM4 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nfe2l3Q9WTM4 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nfe2l3Q9WTM4 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nfe2l3Q9WTM4 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Nfe2l3Q9WTM4 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nfe2l3Q9WTM4 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nfe2l3Q9WTM4 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nfe2l3Q9WTM4 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nfe2l3Q9WTM4 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nfe2l3Q9WTM4 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nfe2l3Q9WTM4 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nfe2l3Q9WTM4 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nfe2l3Q9WTM4 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nfe2l3Q9WTM4 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Nfe2l3Q9WTM4 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nfe2l3Q9WTM4 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nfe2l3Q9WTM4 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Nfe2l3Q9WTM4 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Nfe2l3Q9WTM4 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Nfe2l3Q9WTM4 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nfe2l3Q9WTM4 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Nfe2l3Q9WTM4 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nfe2l3Q9WTM4 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nfe2l3Q9WTM4 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Nfe2l3Q9WTM4 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Nfe2l3Q9WTM4 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nfe2l3Q9WTM4 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nfe2l3Q9WTM4 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nfe2l3Q9WTM4 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nfe2l3Q9WTM4 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nfe2l3Q9WTM4 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nfe2l3Q9WTM4 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nfe2l3Q9WTM4 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nfe2l3Q9WTM4 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nfe2l3Q9WTM4 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nfe2l3Q9WTM4 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nfe2l3Q9WTM4 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nfe2l3Q9WTM4 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nfe2l3Q9WTM4 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nfe2l3Q9WTM4 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nfe2l3Q9WTM4 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nfe2l3Q9WTM4 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms