Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTM3

Sema6c, Semaphorin-6C, mousemouse

Predictions only

Length 931 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6cQ9WTM3 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sema6cQ9WTM3 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Sema6cQ9WTM3 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Sema6cQ9WTM3 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Sema6cQ9WTM3 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sema6cQ9WTM3 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sema6cQ9WTM3 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Sema6cQ9WTM3 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sema6cQ9WTM3 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sema6cQ9WTM3 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sema6cQ9WTM3 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sema6cQ9WTM3 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Sema6cQ9WTM3 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sema6cQ9WTM3 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sema6cQ9WTM3 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sema6cQ9WTM3 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sema6cQ9WTM3 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sema6cQ9WTM3 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sema6cQ9WTM3 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sema6cQ9WTM3 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sema6cQ9WTM3 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sema6cQ9WTM3 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sema6cQ9WTM3 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sema6cQ9WTM3 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sema6cQ9WTM3 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sema6cQ9WTM3 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sema6cQ9WTM3 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Sema6cQ9WTM3 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sema6cQ9WTM3 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sema6cQ9WTM3 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sema6cQ9WTM3 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sema6cQ9WTM3 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sema6cQ9WTM3 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sema6cQ9WTM3 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sema6cQ9WTM3 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sema6cQ9WTM3 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sema6cQ9WTM3 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sema6cQ9WTM3 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sema6cQ9WTM3 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sema6cQ9WTM3 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sema6cQ9WTM3 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sema6cQ9WTM3 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sema6cQ9WTM3 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sema6cQ9WTM3 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Sema6cQ9WTM3 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Sema6cQ9WTM3 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Sema6cQ9WTM3 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sema6cQ9WTM3 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sema6cQ9WTM3 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sema6cQ9WTM3 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sema6cQ9WTM3 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sema6cQ9WTM3 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sema6cQ9WTM3 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sema6cQ9WTM3 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sema6cQ9WTM3 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sema6cQ9WTM3 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sema6cQ9WTM3 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sema6cQ9WTM3 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Sema6cQ9WTM3 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sema6cQ9WTM3 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sema6cQ9WTM3 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sema6cQ9WTM3 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sema6cQ9WTM3 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sema6cQ9WTM3 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sema6cQ9WTM3 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sema6cQ9WTM3 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sema6cQ9WTM3 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sema6cQ9WTM3 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sema6cQ9WTM3 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sema6cQ9WTM3 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sema6cQ9WTM3 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sema6cQ9WTM3 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sema6cQ9WTM3 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sema6cQ9WTM3 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sema6cQ9WTM3 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sema6cQ9WTM3 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sema6cQ9WTM3 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sema6cQ9WTM3 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sema6cQ9WTM3 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sema6cQ9WTM3 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sema6cQ9WTM3 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sema6cQ9WTM3 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sema6cQ9WTM3 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sema6cQ9WTM3 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Sema6cQ9WTM3 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sema6cQ9WTM3 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Sema6cQ9WTM3 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sema6cQ9WTM3 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sema6cQ9WTM3 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sema6cQ9WTM3 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Sema6cQ9WTM3 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sema6cQ9WTM3 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sema6cQ9WTM3 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sema6cQ9WTM3 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sema6cQ9WTM3 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sema6cQ9WTM3 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sema6cQ9WTM3 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sema6cQ9WTM3 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sema6cQ9WTM3 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sema6cQ9WTM3 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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