Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P1

Psmb3, Proteasome subunit beta type-3, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb3Q9R1P1 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Psmb3Q9R1P1 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Psmb3Q9R1P1 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Psmb3Q9R1P1 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Psmb3Q9R1P1 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Psmb3Q9R1P1 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Psmb3Q9R1P1 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Psmb3Q9R1P1 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Psmb3Q9R1P1 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Psmb3Q9R1P1 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Psmb3Q9R1P1 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Psmb3Q9R1P1 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Psmb3Q9R1P1 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Psmb3Q9R1P1 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Psmb3Q9R1P1 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Psmb3Q9R1P1 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Psmb3Q9R1P1 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Psmb3Q9R1P1 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Psmb3Q9R1P1 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Psmb3Q9R1P1 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Psmb3Q9R1P1 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Psmb3Q9R1P1 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Psmb3Q9R1P1 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Psmb3Q9R1P1 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Psmb3Q9R1P1 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Psmb3Q9R1P1 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Psmb3Q9R1P1 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Psmb3Q9R1P1 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Psmb3Q9R1P1 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Psmb3Q9R1P1 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Psmb3Q9R1P1 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Psmb3Q9R1P1 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Psmb3Q9R1P1 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Psmb3Q9R1P1 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Psmb3Q9R1P1 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Psmb3Q9R1P1 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Psmb3Q9R1P1 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Psmb3Q9R1P1 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Psmb3Q9R1P1 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Psmb3Q9R1P1 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Psmb3Q9R1P1 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Psmb3Q9R1P1 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Psmb3Q9R1P1 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Psmb3Q9R1P1 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Psmb3Q9R1P1 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Psmb3Q9R1P1 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Psmb3Q9R1P1 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Psmb3Q9R1P1 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Psmb3Q9R1P1 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Psmb3Q9R1P1 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Psmb3Q9R1P1 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Psmb3Q9R1P1 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Psmb3Q9R1P1 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Psmb3Q9R1P1 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Psmb3Q9R1P1 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Psmb3Q9R1P1 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Psmb3Q9R1P1 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Psmb3Q9R1P1 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Psmb3Q9R1P1 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Psmb3Q9R1P1 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Psmb3Q9R1P1 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Psmb3Q9R1P1 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Psmb3Q9R1P1 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Psmb3Q9R1P1 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Psmb3Q9R1P1 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Psmb3Q9R1P1 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Psmb3Q9R1P1 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Psmb3Q9R1P1 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Psmb3Q9R1P1 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Psmb3Q9R1P1 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Psmb3Q9R1P1 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Psmb3Q9R1P1 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Psmb3Q9R1P1 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Psmb3Q9R1P1 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Psmb3Q9R1P1 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Psmb3Q9R1P1 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Psmb3Q9R1P1 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Psmb3Q9R1P1 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Psmb3Q9R1P1 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Psmb3Q9R1P1 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Psmb3Q9R1P1 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Psmb3Q9R1P1 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Psmb3Q9R1P1 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Psmb3Q9R1P1 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Psmb3Q9R1P1 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Psmb3Q9R1P1 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Psmb3Q9R1P1 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Psmb3Q9R1P1 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Psmb3Q9R1P1 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Psmb3Q9R1P1 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Psmb3Q9R1P1 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Psmb3Q9R1P1 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Psmb3Q9R1P1 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Psmb3Q9R1P1 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Psmb3Q9R1P1 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Psmb3Q9R1P1 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Psmb3Q9R1P1 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Psmb3Q9R1P1 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Psmb3Q9R1P1 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Psmb3Q9R1P1 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 430.4 ms