Protein–RNA interactions for Protein: Q9R087

Gpc6, Glypican-6, mousemouse

Predictions only

Length 555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc6Q9R087 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gpc6Q9R087 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gpc6Q9R087 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gpc6Q9R087 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Gpc6Q9R087 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Gpc6Q9R087 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gpc6Q9R087 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Gpc6Q9R087 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Gpc6Q9R087 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Gpc6Q9R087 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gpc6Q9R087 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gpc6Q9R087 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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Gpc6Q9R087 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gpc6Q9R087 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gpc6Q9R087 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gpc6Q9R087 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gpc6Q9R087 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gpc6Q9R087 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gpc6Q9R087 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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Gpc6Q9R087 AC125117.2-201ENSMUST00000228344 1140 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
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Gpc6Q9R087 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gpc6Q9R087 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gpc6Q9R087 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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Gpc6Q9R087 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gpc6Q9R087 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gpc6Q9R087 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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Gpc6Q9R087 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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Gpc6Q9R087 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gpc6Q9R087 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
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Gpc6Q9R087 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gpc6Q9R087 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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Gpc6Q9R087 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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Gpc6Q9R087 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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Gpc6Q9R087 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gpc6Q9R087 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
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Gpc6Q9R087 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gpc6Q9R087 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gpc6Q9R087 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gpc6Q9R087 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
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Gpc6Q9R087 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gpc6Q9R087 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gpc6Q9R087 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gpc6Q9R087 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gpc6Q9R087 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gpc6Q9R087 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gpc6Q9R087 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gpc6Q9R087 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gpc6Q9R087 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gpc6Q9R087 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gpc6Q9R087 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gpc6Q9R087 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gpc6Q9R087 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gpc6Q9R087 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gpc6Q9R087 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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