Protein–RNA interactions for Protein: Q9R069

Bcam, Basal cell adhesion molecule, mousemouse

Predictions only

Length 622 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BcamQ9R069 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BcamQ9R069 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BcamQ9R069 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BcamQ9R069 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BcamQ9R069 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BcamQ9R069 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BcamQ9R069 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BcamQ9R069 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BcamQ9R069 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BcamQ9R069 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
BcamQ9R069 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BcamQ9R069 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BcamQ9R069 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BcamQ9R069 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BcamQ9R069 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BcamQ9R069 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BcamQ9R069 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BcamQ9R069 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BcamQ9R069 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BcamQ9R069 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BcamQ9R069 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BcamQ9R069 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BcamQ9R069 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BcamQ9R069 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BcamQ9R069 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BcamQ9R069 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BcamQ9R069 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BcamQ9R069 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BcamQ9R069 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BcamQ9R069 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BcamQ9R069 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BcamQ9R069 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BcamQ9R069 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BcamQ9R069 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
BcamQ9R069 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BcamQ9R069 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BcamQ9R069 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BcamQ9R069 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BcamQ9R069 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BcamQ9R069 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BcamQ9R069 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BcamQ9R069 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BcamQ9R069 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BcamQ9R069 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BcamQ9R069 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BcamQ9R069 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BcamQ9R069 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BcamQ9R069 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BcamQ9R069 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BcamQ9R069 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BcamQ9R069 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BcamQ9R069 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BcamQ9R069 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BcamQ9R069 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BcamQ9R069 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BcamQ9R069 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BcamQ9R069 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BcamQ9R069 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BcamQ9R069 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BcamQ9R069 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BcamQ9R069 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BcamQ9R069 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BcamQ9R069 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BcamQ9R069 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BcamQ9R069 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BcamQ9R069 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BcamQ9R069 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BcamQ9R069 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
BcamQ9R069 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
BcamQ9R069 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BcamQ9R069 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BcamQ9R069 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BcamQ9R069 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BcamQ9R069 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BcamQ9R069 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
BcamQ9R069 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BcamQ9R069 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BcamQ9R069 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BcamQ9R069 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BcamQ9R069 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BcamQ9R069 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BcamQ9R069 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BcamQ9R069 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BcamQ9R069 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BcamQ9R069 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BcamQ9R069 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BcamQ9R069 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BcamQ9R069 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BcamQ9R069 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BcamQ9R069 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BcamQ9R069 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BcamQ9R069 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BcamQ9R069 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
BcamQ9R069 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BcamQ9R069 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BcamQ9R069 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
BcamQ9R069 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
BcamQ9R069 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
BcamQ9R069 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BcamQ9R069 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms