Protein–RNA interactions for Protein: Q9R049

Amfr, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, mousemouse

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmfrQ9R049 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AmfrQ9R049 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AmfrQ9R049 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AmfrQ9R049 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AmfrQ9R049 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AmfrQ9R049 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AmfrQ9R049 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AmfrQ9R049 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AmfrQ9R049 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AmfrQ9R049 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AmfrQ9R049 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AmfrQ9R049 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AmfrQ9R049 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AmfrQ9R049 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
AmfrQ9R049 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AmfrQ9R049 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AmfrQ9R049 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AmfrQ9R049 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AmfrQ9R049 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AmfrQ9R049 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AmfrQ9R049 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AmfrQ9R049 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AmfrQ9R049 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AmfrQ9R049 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AmfrQ9R049 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
AmfrQ9R049 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
AmfrQ9R049 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
AmfrQ9R049 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
AmfrQ9R049 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
AmfrQ9R049 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
AmfrQ9R049 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
AmfrQ9R049 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AmfrQ9R049 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AmfrQ9R049 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AmfrQ9R049 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AmfrQ9R049 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AmfrQ9R049 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AmfrQ9R049 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AmfrQ9R049 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AmfrQ9R049 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AmfrQ9R049 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AmfrQ9R049 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AmfrQ9R049 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AmfrQ9R049 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AmfrQ9R049 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AmfrQ9R049 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AmfrQ9R049 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AmfrQ9R049 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AmfrQ9R049 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
AmfrQ9R049 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AmfrQ9R049 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AmfrQ9R049 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AmfrQ9R049 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AmfrQ9R049 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AmfrQ9R049 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AmfrQ9R049 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AmfrQ9R049 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AmfrQ9R049 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AmfrQ9R049 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AmfrQ9R049 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AmfrQ9R049 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AmfrQ9R049 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AmfrQ9R049 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AmfrQ9R049 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AmfrQ9R049 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AmfrQ9R049 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AmfrQ9R049 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AmfrQ9R049 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AmfrQ9R049 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AmfrQ9R049 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AmfrQ9R049 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AmfrQ9R049 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AmfrQ9R049 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AmfrQ9R049 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AmfrQ9R049 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AmfrQ9R049 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AmfrQ9R049 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AmfrQ9R049 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AmfrQ9R049 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AmfrQ9R049 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AmfrQ9R049 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AmfrQ9R049 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AmfrQ9R049 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
AmfrQ9R049 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AmfrQ9R049 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AmfrQ9R049 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AmfrQ9R049 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AmfrQ9R049 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AmfrQ9R049 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AmfrQ9R049 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AmfrQ9R049 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AmfrQ9R049 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AmfrQ9R049 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AmfrQ9R049 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AmfrQ9R049 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AmfrQ9R049 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AmfrQ9R049 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AmfrQ9R049 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AmfrQ9R049 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AmfrQ9R049 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms