Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf4Q9QZS2 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf4Q9QZS2 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf4Q9QZS2 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf4Q9QZS2 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf4Q9QZS2 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf4Q9QZS2 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf4Q9QZS2 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf4Q9QZS2 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf4Q9QZS2 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf4Q9QZS2 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf4Q9QZS2 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf4Q9QZS2 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf4Q9QZS2 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf4Q9QZS2 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf4Q9QZS2 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf4Q9QZS2 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf4Q9QZS2 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf4Q9QZS2 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf4Q9QZS2 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf4Q9QZS2 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf4Q9QZS2 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf4Q9QZS2 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf4Q9QZS2 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf4Q9QZS2 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf4Q9QZS2 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf4Q9QZS2 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf4Q9QZS2 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf4Q9QZS2 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf4Q9QZS2 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf4Q9QZS2 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf4Q9QZS2 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf4Q9QZS2 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf4Q9QZS2 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf4Q9QZS2 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf4Q9QZS2 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf4Q9QZS2 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf4Q9QZS2 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf4Q9QZS2 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf4Q9QZS2 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf4Q9QZS2 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf4Q9QZS2 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf4Q9QZS2 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf4Q9QZS2 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf4Q9QZS2 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf4Q9QZS2 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf4Q9QZS2 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf4Q9QZS2 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf4Q9QZS2 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf4Q9QZS2 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf4Q9QZS2 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf4Q9QZS2 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf4Q9QZS2 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf4Q9QZS2 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf4Q9QZS2 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf4Q9QZS2 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf4Q9QZS2 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf4Q9QZS2 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf4Q9QZS2 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf4Q9QZS2 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf4Q9QZS2 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf4Q9QZS2 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf4Q9QZS2 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf4Q9QZS2 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf4Q9QZS2 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf4Q9QZS2 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf4Q9QZS2 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf4Q9QZS2 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf4Q9QZS2 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf4Q9QZS2 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf4Q9QZS2 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf4Q9QZS2 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf4Q9QZS2 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf4Q9QZS2 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf4Q9QZS2 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf4Q9QZS2 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf4Q9QZS2 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf4Q9QZS2 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf4Q9QZS2 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf4Q9QZS2 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf4Q9QZS2 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf4Q9QZS2 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf4Q9QZS2 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf4Q9QZS2 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf4Q9QZS2 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf4Q9QZS2 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf4Q9QZS2 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf4Q9QZS2 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf4Q9QZS2 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf4Q9QZS2 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf4Q9QZS2 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf4Q9QZS2 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf4Q9QZS2 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf4Q9QZS2 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf4Q9QZS2 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf4Q9QZS2 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf4Q9QZS2 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf4Q9QZS2 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf4Q9QZS2 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf4Q9QZS2 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms