Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Col4a3Q9QZS0 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Col4a3Q9QZS0 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Col4a3Q9QZS0 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Col4a3Q9QZS0 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Col4a3Q9QZS0 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Col4a3Q9QZS0 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Col4a3Q9QZS0 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Col4a3Q9QZS0 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Col4a3Q9QZS0 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Col4a3Q9QZS0 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Col4a3Q9QZS0 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Col4a3Q9QZS0 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Col4a3Q9QZS0 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Col4a3Q9QZS0 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Col4a3Q9QZS0 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Col4a3Q9QZS0 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Col4a3Q9QZS0 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Col4a3Q9QZS0 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Col4a3Q9QZS0 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Col4a3Q9QZS0 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Col4a3Q9QZS0 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Col4a3Q9QZS0 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Col4a3Q9QZS0 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Col4a3Q9QZS0 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col4a3Q9QZS0 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col4a3Q9QZS0 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col4a3Q9QZS0 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col4a3Q9QZS0 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col4a3Q9QZS0 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col4a3Q9QZS0 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col4a3Q9QZS0 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col4a3Q9QZS0 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Col4a3Q9QZS0 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col4a3Q9QZS0 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Col4a3Q9QZS0 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Col4a3Q9QZS0 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Col4a3Q9QZS0 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Col4a3Q9QZS0 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col4a3Q9QZS0 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col4a3Q9QZS0 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col4a3Q9QZS0 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col4a3Q9QZS0 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col4a3Q9QZS0 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col4a3Q9QZS0 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col4a3Q9QZS0 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Col4a3Q9QZS0 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col4a3Q9QZS0 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col4a3Q9QZS0 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col4a3Q9QZS0 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col4a3Q9QZS0 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col4a3Q9QZS0 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col4a3Q9QZS0 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Col4a3Q9QZS0 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Col4a3Q9QZS0 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Col4a3Q9QZS0 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Col4a3Q9QZS0 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Col4a3Q9QZS0 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Col4a3Q9QZS0 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Col4a3Q9QZS0 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Col4a3Q9QZS0 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Col4a3Q9QZS0 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Col4a3Q9QZS0 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Col4a3Q9QZS0 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Col4a3Q9QZS0 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Col4a3Q9QZS0 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Col4a3Q9QZS0 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Col4a3Q9QZS0 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Col4a3Q9QZS0 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Col4a3Q9QZS0 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Col4a3Q9QZS0 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Col4a3Q9QZS0 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Col4a3Q9QZS0 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Col4a3Q9QZS0 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Col4a3Q9QZS0 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Col4a3Q9QZS0 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Col4a3Q9QZS0 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Col4a3Q9QZS0 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Col4a3Q9QZS0 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Col4a3Q9QZS0 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Col4a3Q9QZS0 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Col4a3Q9QZS0 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Col4a3Q9QZS0 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Col4a3Q9QZS0 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Col4a3Q9QZS0 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Col4a3Q9QZS0 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Col4a3Q9QZS0 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Col4a3Q9QZS0 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Col4a3Q9QZS0 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Col4a3Q9QZS0 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Col4a3Q9QZS0 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Col4a3Q9QZS0 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Col4a3Q9QZS0 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Col4a3Q9QZS0 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Col4a3Q9QZS0 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Col4a3Q9QZS0 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Col4a3Q9QZS0 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Col4a3Q9QZS0 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Col4a3Q9QZS0 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Col4a3Q9QZS0 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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