Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZR0

Rnf25, E3 ubiquitin-protein ligase RNF25, mousemouse

Predictions only

Length 456 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf25Q9QZR0 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rnf25Q9QZR0 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rnf25Q9QZR0 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rnf25Q9QZR0 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rnf25Q9QZR0 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rnf25Q9QZR0 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rnf25Q9QZR0 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf25Q9QZR0 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf25Q9QZR0 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf25Q9QZR0 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf25Q9QZR0 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf25Q9QZR0 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf25Q9QZR0 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf25Q9QZR0 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf25Q9QZR0 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf25Q9QZR0 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf25Q9QZR0 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf25Q9QZR0 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf25Q9QZR0 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf25Q9QZR0 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf25Q9QZR0 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf25Q9QZR0 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf25Q9QZR0 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf25Q9QZR0 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf25Q9QZR0 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf25Q9QZR0 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf25Q9QZR0 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf25Q9QZR0 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf25Q9QZR0 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf25Q9QZR0 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf25Q9QZR0 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf25Q9QZR0 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf25Q9QZR0 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf25Q9QZR0 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf25Q9QZR0 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf25Q9QZR0 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf25Q9QZR0 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf25Q9QZR0 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf25Q9QZR0 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf25Q9QZR0 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf25Q9QZR0 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf25Q9QZR0 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf25Q9QZR0 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf25Q9QZR0 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf25Q9QZR0 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf25Q9QZR0 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf25Q9QZR0 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf25Q9QZR0 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf25Q9QZR0 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf25Q9QZR0 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf25Q9QZR0 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf25Q9QZR0 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf25Q9QZR0 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf25Q9QZR0 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf25Q9QZR0 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf25Q9QZR0 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf25Q9QZR0 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf25Q9QZR0 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf25Q9QZR0 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf25Q9QZR0 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf25Q9QZR0 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf25Q9QZR0 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf25Q9QZR0 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf25Q9QZR0 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf25Q9QZR0 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf25Q9QZR0 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf25Q9QZR0 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf25Q9QZR0 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf25Q9QZR0 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf25Q9QZR0 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf25Q9QZR0 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf25Q9QZR0 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf25Q9QZR0 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf25Q9QZR0 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf25Q9QZR0 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf25Q9QZR0 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf25Q9QZR0 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf25Q9QZR0 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf25Q9QZR0 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf25Q9QZR0 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf25Q9QZR0 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf25Q9QZR0 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf25Q9QZR0 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf25Q9QZR0 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf25Q9QZR0 Cdk5rap1-202ENSMUST00000109730 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf25Q9QZR0 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf25Q9QZR0 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf25Q9QZR0 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf25Q9QZR0 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf25Q9QZR0 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf25Q9QZR0 2210412B16Rik-201ENSMUST00000201281 498 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf25Q9QZR0 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf25Q9QZR0 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf25Q9QZR0 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf25Q9QZR0 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf25Q9QZR0 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf25Q9QZR0 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf25Q9QZR0 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf25Q9QZR0 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf25Q9QZR0 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms