Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZL0

Ripk3, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ripk3Q9QZL0 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ripk3Q9QZL0 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ripk3Q9QZL0 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ripk3Q9QZL0 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ripk3Q9QZL0 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ripk3Q9QZL0 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ripk3Q9QZL0 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ripk3Q9QZL0 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ripk3Q9QZL0 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ripk3Q9QZL0 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ripk3Q9QZL0 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ripk3Q9QZL0 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ripk3Q9QZL0 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ripk3Q9QZL0 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ripk3Q9QZL0 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ripk3Q9QZL0 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ripk3Q9QZL0 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ripk3Q9QZL0 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ripk3Q9QZL0 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ripk3Q9QZL0 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ripk3Q9QZL0 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ripk3Q9QZL0 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ripk3Q9QZL0 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ripk3Q9QZL0 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ripk3Q9QZL0 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ripk3Q9QZL0 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ripk3Q9QZL0 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ripk3Q9QZL0 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ripk3Q9QZL0 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ripk3Q9QZL0 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ripk3Q9QZL0 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ripk3Q9QZL0 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ripk3Q9QZL0 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ripk3Q9QZL0 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ripk3Q9QZL0 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ripk3Q9QZL0 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ripk3Q9QZL0 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ripk3Q9QZL0 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ripk3Q9QZL0 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ripk3Q9QZL0 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ripk3Q9QZL0 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ripk3Q9QZL0 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ripk3Q9QZL0 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ripk3Q9QZL0 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ripk3Q9QZL0 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ripk3Q9QZL0 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ripk3Q9QZL0 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ripk3Q9QZL0 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ripk3Q9QZL0 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ripk3Q9QZL0 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ripk3Q9QZL0 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ripk3Q9QZL0 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ripk3Q9QZL0 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ripk3Q9QZL0 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ripk3Q9QZL0 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ripk3Q9QZL0 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ripk3Q9QZL0 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ripk3Q9QZL0 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ripk3Q9QZL0 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ripk3Q9QZL0 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Ripk3Q9QZL0 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ripk3Q9QZL0 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ripk3Q9QZL0 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ripk3Q9QZL0 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ripk3Q9QZL0 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ripk3Q9QZL0 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ripk3Q9QZL0 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ripk3Q9QZL0 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ripk3Q9QZL0 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ripk3Q9QZL0 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ripk3Q9QZL0 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ripk3Q9QZL0 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ripk3Q9QZL0 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ripk3Q9QZL0 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ripk3Q9QZL0 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ripk3Q9QZL0 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ripk3Q9QZL0 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ripk3Q9QZL0 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ripk3Q9QZL0 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ripk3Q9QZL0 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ripk3Q9QZL0 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ripk3Q9QZL0 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ripk3Q9QZL0 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ripk3Q9QZL0 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ripk3Q9QZL0 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ripk3Q9QZL0 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ripk3Q9QZL0 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ripk3Q9QZL0 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ripk3Q9QZL0 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ripk3Q9QZL0 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ripk3Q9QZL0 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ripk3Q9QZL0 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ripk3Q9QZL0 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ripk3Q9QZL0 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ripk3Q9QZL0 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ripk3Q9QZL0 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ripk3Q9QZL0 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ripk3Q9QZL0 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ripk3Q9QZL0 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ripk3Q9QZL0 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms