Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD4

Ercc4, DNA repair endonuclease XPF, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc4Q9QZD4 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ercc4Q9QZD4 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Ercc4Q9QZD4 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ercc4Q9QZD4 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Ercc4Q9QZD4 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ercc4Q9QZD4 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ercc4Q9QZD4 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ercc4Q9QZD4 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ercc4Q9QZD4 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ercc4Q9QZD4 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ercc4Q9QZD4 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ercc4Q9QZD4 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ercc4Q9QZD4 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ercc4Q9QZD4 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ercc4Q9QZD4 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ercc4Q9QZD4 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ercc4Q9QZD4 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ercc4Q9QZD4 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Ercc4Q9QZD4 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ercc4Q9QZD4 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ercc4Q9QZD4 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ercc4Q9QZD4 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ercc4Q9QZD4 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ercc4Q9QZD4 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ercc4Q9QZD4 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Ercc4Q9QZD4 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ercc4Q9QZD4 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ercc4Q9QZD4 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ercc4Q9QZD4 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Ercc4Q9QZD4 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Ercc4Q9QZD4 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ercc4Q9QZD4 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ercc4Q9QZD4 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ercc4Q9QZD4 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Ercc4Q9QZD4 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ercc4Q9QZD4 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ercc4Q9QZD4 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ercc4Q9QZD4 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ercc4Q9QZD4 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ercc4Q9QZD4 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ercc4Q9QZD4 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ercc4Q9QZD4 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ercc4Q9QZD4 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ercc4Q9QZD4 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ercc4Q9QZD4 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ercc4Q9QZD4 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ercc4Q9QZD4 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ercc4Q9QZD4 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ercc4Q9QZD4 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ercc4Q9QZD4 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ercc4Q9QZD4 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ercc4Q9QZD4 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ercc4Q9QZD4 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ercc4Q9QZD4 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Ercc4Q9QZD4 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Ercc4Q9QZD4 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ercc4Q9QZD4 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ercc4Q9QZD4 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ercc4Q9QZD4 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ercc4Q9QZD4 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ercc4Q9QZD4 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ercc4Q9QZD4 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ercc4Q9QZD4 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ercc4Q9QZD4 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ercc4Q9QZD4 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Ercc4Q9QZD4 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ercc4Q9QZD4 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Ercc4Q9QZD4 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ercc4Q9QZD4 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ercc4Q9QZD4 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ercc4Q9QZD4 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ercc4Q9QZD4 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ercc4Q9QZD4 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ercc4Q9QZD4 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ercc4Q9QZD4 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ercc4Q9QZD4 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ercc4Q9QZD4 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ercc4Q9QZD4 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ercc4Q9QZD4 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ercc4Q9QZD4 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ercc4Q9QZD4 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ercc4Q9QZD4 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ercc4Q9QZD4 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ercc4Q9QZD4 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ercc4Q9QZD4 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ercc4Q9QZD4 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ercc4Q9QZD4 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ercc4Q9QZD4 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ercc4Q9QZD4 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ercc4Q9QZD4 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ercc4Q9QZD4 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ercc4Q9QZD4 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ercc4Q9QZD4 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ercc4Q9QZD4 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ercc4Q9QZD4 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ercc4Q9QZD4 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ercc4Q9QZD4 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ercc4Q9QZD4 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ercc4Q9QZD4 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Ercc4Q9QZD4 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms