Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ09

Phtf1, Putative homeodomain transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phtf1Q9QZ09 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phtf1Q9QZ09 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phtf1Q9QZ09 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phtf1Q9QZ09 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phtf1Q9QZ09 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phtf1Q9QZ09 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Phtf1Q9QZ09 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Phtf1Q9QZ09 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Phtf1Q9QZ09 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Phtf1Q9QZ09 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Phtf1Q9QZ09 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Phtf1Q9QZ09 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Phtf1Q9QZ09 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Phtf1Q9QZ09 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Phtf1Q9QZ09 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Phtf1Q9QZ09 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Phtf1Q9QZ09 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Phtf1Q9QZ09 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Phtf1Q9QZ09 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Phtf1Q9QZ09 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Phtf1Q9QZ09 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Phtf1Q9QZ09 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Phtf1Q9QZ09 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Phtf1Q9QZ09 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Phtf1Q9QZ09 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Phtf1Q9QZ09 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Phtf1Q9QZ09 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Phtf1Q9QZ09 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Phtf1Q9QZ09 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Phtf1Q9QZ09 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Phtf1Q9QZ09 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Phtf1Q9QZ09 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Phtf1Q9QZ09 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Phtf1Q9QZ09 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Phtf1Q9QZ09 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Phtf1Q9QZ09 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Phtf1Q9QZ09 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Phtf1Q9QZ09 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Phtf1Q9QZ09 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Phtf1Q9QZ09 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Phtf1Q9QZ09 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Phtf1Q9QZ09 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Phtf1Q9QZ09 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Phtf1Q9QZ09 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Phtf1Q9QZ09 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Phtf1Q9QZ09 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Phtf1Q9QZ09 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Phtf1Q9QZ09 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Phtf1Q9QZ09 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Phtf1Q9QZ09 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Phtf1Q9QZ09 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Phtf1Q9QZ09 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Phtf1Q9QZ09 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Phtf1Q9QZ09 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Phtf1Q9QZ09 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Phtf1Q9QZ09 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Phtf1Q9QZ09 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Phtf1Q9QZ09 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Phtf1Q9QZ09 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Phtf1Q9QZ09 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Phtf1Q9QZ09 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Phtf1Q9QZ09 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Phtf1Q9QZ09 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Phtf1Q9QZ09 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Phtf1Q9QZ09 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Phtf1Q9QZ09 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Phtf1Q9QZ09 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Phtf1Q9QZ09 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Phtf1Q9QZ09 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Phtf1Q9QZ09 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Phtf1Q9QZ09 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Phtf1Q9QZ09 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Phtf1Q9QZ09 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Phtf1Q9QZ09 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Phtf1Q9QZ09 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Phtf1Q9QZ09 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Phtf1Q9QZ09 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phtf1Q9QZ09 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phtf1Q9QZ09 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phtf1Q9QZ09 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phtf1Q9QZ09 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phtf1Q9QZ09 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phtf1Q9QZ09 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phtf1Q9QZ09 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phtf1Q9QZ09 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phtf1Q9QZ09 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phtf1Q9QZ09 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phtf1Q9QZ09 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phtf1Q9QZ09 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phtf1Q9QZ09 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phtf1Q9QZ09 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phtf1Q9QZ09 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phtf1Q9QZ09 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Phtf1Q9QZ09 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Phtf1Q9QZ09 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phtf1Q9QZ09 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phtf1Q9QZ09 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phtf1Q9QZ09 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phtf1Q9QZ09 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phtf1Q9QZ09 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms