Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYF1

Rdh11, Retinol dehydrogenase 11, mousemouse

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh11Q9QYF1 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Rdh11Q9QYF1 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rdh11Q9QYF1 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rdh11Q9QYF1 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rdh11Q9QYF1 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rdh11Q9QYF1 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rdh11Q9QYF1 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Rdh11Q9QYF1 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rdh11Q9QYF1 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rdh11Q9QYF1 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rdh11Q9QYF1 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rdh11Q9QYF1 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rdh11Q9QYF1 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rdh11Q9QYF1 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rdh11Q9QYF1 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rdh11Q9QYF1 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rdh11Q9QYF1 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rdh11Q9QYF1 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rdh11Q9QYF1 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rdh11Q9QYF1 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rdh11Q9QYF1 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rdh11Q9QYF1 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Rdh11Q9QYF1 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rdh11Q9QYF1 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Rdh11Q9QYF1 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rdh11Q9QYF1 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rdh11Q9QYF1 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Rdh11Q9QYF1 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rdh11Q9QYF1 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rdh11Q9QYF1 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Rdh11Q9QYF1 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Rdh11Q9QYF1 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rdh11Q9QYF1 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Rdh11Q9QYF1 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Rdh11Q9QYF1 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rdh11Q9QYF1 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rdh11Q9QYF1 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rdh11Q9QYF1 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rdh11Q9QYF1 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rdh11Q9QYF1 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Rdh11Q9QYF1 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Rdh11Q9QYF1 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rdh11Q9QYF1 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Rdh11Q9QYF1 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rdh11Q9QYF1 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rdh11Q9QYF1 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rdh11Q9QYF1 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rdh11Q9QYF1 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rdh11Q9QYF1 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Rdh11Q9QYF1 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rdh11Q9QYF1 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rdh11Q9QYF1 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rdh11Q9QYF1 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rdh11Q9QYF1 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rdh11Q9QYF1 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rdh11Q9QYF1 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rdh11Q9QYF1 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rdh11Q9QYF1 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rdh11Q9QYF1 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rdh11Q9QYF1 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rdh11Q9QYF1 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rdh11Q9QYF1 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rdh11Q9QYF1 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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