Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM96

Cdc42ep4, Cdc42 effector protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc42ep4Q9JM96 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdc42ep4Q9JM96 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdc42ep4Q9JM96 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdc42ep4Q9JM96 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdc42ep4Q9JM96 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdc42ep4Q9JM96 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdc42ep4Q9JM96 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdc42ep4Q9JM96 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdc42ep4Q9JM96 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdc42ep4Q9JM96 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdc42ep4Q9JM96 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdc42ep4Q9JM96 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdc42ep4Q9JM96 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdc42ep4Q9JM96 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdc42ep4Q9JM96 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdc42ep4Q9JM96 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdc42ep4Q9JM96 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdc42ep4Q9JM96 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdc42ep4Q9JM96 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdc42ep4Q9JM96 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdc42ep4Q9JM96 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdc42ep4Q9JM96 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdc42ep4Q9JM96 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdc42ep4Q9JM96 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdc42ep4Q9JM96 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdc42ep4Q9JM96 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdc42ep4Q9JM96 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdc42ep4Q9JM96 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdc42ep4Q9JM96 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdc42ep4Q9JM96 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdc42ep4Q9JM96 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdc42ep4Q9JM96 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdc42ep4Q9JM96 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdc42ep4Q9JM96 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdc42ep4Q9JM96 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdc42ep4Q9JM96 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdc42ep4Q9JM96 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdc42ep4Q9JM96 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdc42ep4Q9JM96 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdc42ep4Q9JM96 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdc42ep4Q9JM96 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdc42ep4Q9JM96 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdc42ep4Q9JM96 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdc42ep4Q9JM96 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdc42ep4Q9JM96 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdc42ep4Q9JM96 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdc42ep4Q9JM96 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdc42ep4Q9JM96 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdc42ep4Q9JM96 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdc42ep4Q9JM96 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdc42ep4Q9JM96 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdc42ep4Q9JM96 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdc42ep4Q9JM96 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdc42ep4Q9JM96 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdc42ep4Q9JM96 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdc42ep4Q9JM96 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdc42ep4Q9JM96 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdc42ep4Q9JM96 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdc42ep4Q9JM96 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdc42ep4Q9JM96 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdc42ep4Q9JM96 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdc42ep4Q9JM96 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdc42ep4Q9JM96 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdc42ep4Q9JM96 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdc42ep4Q9JM96 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdc42ep4Q9JM96 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdc42ep4Q9JM96 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdc42ep4Q9JM96 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdc42ep4Q9JM96 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdc42ep4Q9JM96 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdc42ep4Q9JM96 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdc42ep4Q9JM96 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdc42ep4Q9JM96 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdc42ep4Q9JM96 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdc42ep4Q9JM96 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdc42ep4Q9JM96 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdc42ep4Q9JM96 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdc42ep4Q9JM96 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdc42ep4Q9JM96 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdc42ep4Q9JM96 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdc42ep4Q9JM96 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdc42ep4Q9JM96 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdc42ep4Q9JM96 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdc42ep4Q9JM96 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdc42ep4Q9JM96 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdc42ep4Q9JM96 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdc42ep4Q9JM96 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdc42ep4Q9JM96 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdc42ep4Q9JM96 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdc42ep4Q9JM96 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdc42ep4Q9JM96 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdc42ep4Q9JM96 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdc42ep4Q9JM96 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdc42ep4Q9JM96 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdc42ep4Q9JM96 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdc42ep4Q9JM96 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdc42ep4Q9JM96 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdc42ep4Q9JM96 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdc42ep4Q9JM96 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdc42ep4Q9JM96 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms