Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLZ8

Sigirr, Single Ig IL-1-related receptor, mousemouse

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Length 409 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SigirrQ9JLZ8 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SigirrQ9JLZ8 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SigirrQ9JLZ8 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
SigirrQ9JLZ8 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
SigirrQ9JLZ8 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
SigirrQ9JLZ8 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SigirrQ9JLZ8 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SigirrQ9JLZ8 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SigirrQ9JLZ8 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
SigirrQ9JLZ8 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
SigirrQ9JLZ8 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SigirrQ9JLZ8 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SigirrQ9JLZ8 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
SigirrQ9JLZ8 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SigirrQ9JLZ8 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SigirrQ9JLZ8 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
SigirrQ9JLZ8 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SigirrQ9JLZ8 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SigirrQ9JLZ8 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SigirrQ9JLZ8 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SigirrQ9JLZ8 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SigirrQ9JLZ8 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SigirrQ9JLZ8 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SigirrQ9JLZ8 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
SigirrQ9JLZ8 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SigirrQ9JLZ8 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SigirrQ9JLZ8 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SigirrQ9JLZ8 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SigirrQ9JLZ8 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SigirrQ9JLZ8 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SigirrQ9JLZ8 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SigirrQ9JLZ8 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SigirrQ9JLZ8 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SigirrQ9JLZ8 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SigirrQ9JLZ8 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SigirrQ9JLZ8 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SigirrQ9JLZ8 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SigirrQ9JLZ8 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SigirrQ9JLZ8 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SigirrQ9JLZ8 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SigirrQ9JLZ8 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SigirrQ9JLZ8 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SigirrQ9JLZ8 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SigirrQ9JLZ8 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SigirrQ9JLZ8 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SigirrQ9JLZ8 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SigirrQ9JLZ8 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
SigirrQ9JLZ8 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SigirrQ9JLZ8 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SigirrQ9JLZ8 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SigirrQ9JLZ8 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SigirrQ9JLZ8 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
SigirrQ9JLZ8 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SigirrQ9JLZ8 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SigirrQ9JLZ8 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
SigirrQ9JLZ8 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SigirrQ9JLZ8 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SigirrQ9JLZ8 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SigirrQ9JLZ8 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SigirrQ9JLZ8 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SigirrQ9JLZ8 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SigirrQ9JLZ8 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
SigirrQ9JLZ8 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
SigirrQ9JLZ8 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
SigirrQ9JLZ8 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SigirrQ9JLZ8 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
SigirrQ9JLZ8 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SigirrQ9JLZ8 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SigirrQ9JLZ8 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SigirrQ9JLZ8 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SigirrQ9JLZ8 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SigirrQ9JLZ8 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SigirrQ9JLZ8 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SigirrQ9JLZ8 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SigirrQ9JLZ8 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SigirrQ9JLZ8 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
SigirrQ9JLZ8 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SigirrQ9JLZ8 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SigirrQ9JLZ8 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SigirrQ9JLZ8 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SigirrQ9JLZ8 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SigirrQ9JLZ8 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
SigirrQ9JLZ8 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SigirrQ9JLZ8 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SigirrQ9JLZ8 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SigirrQ9JLZ8 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SigirrQ9JLZ8 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SigirrQ9JLZ8 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SigirrQ9JLZ8 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SigirrQ9JLZ8 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SigirrQ9JLZ8 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SigirrQ9JLZ8 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SigirrQ9JLZ8 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SigirrQ9JLZ8 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SigirrQ9JLZ8 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SigirrQ9JLZ8 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SigirrQ9JLZ8 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SigirrQ9JLZ8 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SigirrQ9JLZ8 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SigirrQ9JLZ8 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms